1、計稅依據不同
計稅依據是查賬征收與核定征收最大的區別，查賬征收是以所得稅額為計稅依據的，可以簡單的為以利潤為計稅依據。核定征收是以收入*征定率得出的所得稅額為計稅依據。
2、申報表不同
查賬征收的申報表是a類報表，核定征收的申報表是b類報表。
3、填寫內容不同
查賬征收需要填寫，收入、成本、利潤總額。核定征收只需要填收入即可。
4、匯算清繳不同
查賬征收的匯算清繳相當的麻煩，需要計算各種費用的標準，以及提出超額的費用。核定征收相對比較簡單，只需算準收入即可。
5、財務管理不同
查賬征收適用與財務管理健全的企業，核定征收是用於財務管理不健全，成本或者費用無法準確計算的企業。
6、選擇企業不同
選擇企業不同，主要是指企業是壹般納稅人，還是小規模納稅人。簡單的來說就是，通常查賬征收適用於壹般納稅人，核定征收適用於，成本或費用無法準確計算的小規模企業。
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查賬征收的稅收影響
壹般定額征收對企業來講的影響，主要看妳企業的實際情況而論；
查賬征收與定額征收都可以預繳，因為稅務有時完不成任務，他會要求妳提前繳納壹定數額的稅款，留待以後抵減；
定額征收的企業不享有進項權；
查賬征收的不壹定都是壹般納稅人，定額征收的也不壹定都是小規模納稅人，這與妳企業實際情況和當地稅務局的要求來決定的。
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百度百科-查賬征收