（壹）壹科
負責發展改革、財政、稅務、招商引資、開發區、公安、司法、人事、監察、審計、統計、金融保險、物價、信訪、政府法制、科技、郵政、電信等方面的文電辦理、工作聯系與協調。
（二）二科
負責商務、供銷、旅遊、工商、物資、外事、僑務、對臺事務、民族宗教等方面的文電辦理、工作聯系與協調。
（三）三科
負責農業、林業、水務、水產、漁政、民政、氣象、扶貧、計劃生育等方面的文電辦理、工作聯系與協調。
（四）四科
負責國土資源、環保、城市建設、市容管理、房地產、地震、人防、殘聯等方面的文電辦理、工作聯系與協調。
（五）五科
負責教育、文化、衛生、體育、廣播電視、檔案和地方誌等方面的的文電辦理、工作聯系與協調。
（六）六科
負責工業、交通、安全生產、勞動和社會保障、質量技術監督、食品藥品監督管理等方面的文電辦理、工作聯系與協調。
（七）行政科
負責本室人事、勞動、工會和思想政治工作。管理辦公室財務、車輛調度以及後勤、衛生、接待等工作。承擔市政府召開的會議和室黨組會議、主任辦公會議等會務工作。負責市政府辦公室管理的老幹部服務等工作。
（八）文檔科
負責文電收發、分辦、催辦、文印、歸檔、機要、印鑒管理等工作。負責辦公室保密工作。與市委辦公室***同管理市直機關公文交換站。負責指導下級機關公文處理工作。
（九）信息科
負責收集、整理、編印、報送政務信息，及時報送緊急、重大信息，並負責編印《昨日動態》、《每日報摘》。負責室內辦公自動化工作。
（十）聯絡科（總值班室）
負責市政府值班、市長熱線電話和群眾來訪接待工作。負責與市政府駐外機構的聯絡、協調等工作。
（十壹）法規科
起草、審核規範性文件，負責市政府部門和縣區政府的文件備案工作以及文件上報備案工作，承辦規章草案征求意見工作。協調執法矛盾與爭議，為市政府重大決策提供法律依據。承擔政府法制宣傳、協助市政府部門開展法制培訓等工作。
研究行政執法中帶有普遍性的問題，向市政府提出完善有關行政執法制度的意見。參與市政府部門檢查法律、法規、規章和規範性文件的執行情況。負責管理行政執法證件。承辦行政復議、行政賠償案件和受市政府委托依法出庭應訴等項工作。
（十二）市政府督查室
負責督促、檢查國務院、省政府和市政府重要文件、重大決策和重要工作部署的貫徹落實情況。督查市人代會審議通過的《政府工作報告》提出的各項工作目標。督辦市政府常務會議、市長辦公會議、市政府全體（擴大）會議決定的重大事項和市領導重要批示事項。督辦市人大常委會就政府工作作出的決議、決策和提出的審議意見。辦理人大議案、代表建議和政協委員提案。