1906年，清朝宣布“預備立憲”，精簡機構，改革中央部門，合並壹些職能重疊的部門，組成大部門。具體做法是將太常寺、光祿寺、紅紅寺並入禮部，工業部並入商業部，定名為農工商部。太仆寺並入兵部，改稱兵部，國子監並入戶部。當然，這些合並部門由來已久。
常思廟作為清代的祭祀機構，自秦漢以來就壹直存在。但到了清代，其職責被禮部所取代，禮部只負責壹些祭祀儀式。光思寺是清代的宴會管理機構，職責與禮儀部門重疊嚴重。戊戌變法期間(1898)，並入禮部，後又分離，最後並入禮部。鴻福寺是清代專門從事禮儀的機構，其職責與禮儀司同等重要。戊戌變法(1898)時並入禮部，這次又合並了。
清朝工商部創建於天聰五年，即公元1631年。它是壹個管理國家事務和宮殿工程的機構，負責民用建築系統、器皿的使用、運河和堰的分散和降低方法以及提供上億墳墓的法典。土木工程、水利工程、機械制造工程、礦冶、紡織等官辦行業。都是對全國負責，負責壹些金融貨幣的統壹計量。當時有富發堂、元局、火藥局。在這次光緒的行政改革中，這些機構都被廢除了。
太仆寺是清代管理馬正的機構。轄區內有唆麻廠，但軍務部和八旗主要負責國家使用的軍需。太普寺只是壹些皇室需要備馬供皇帝視察。實際上已經成為軍務部門的壹個分支。此外，國子監被廢除，國子監中的學校被分配到以前建立的部門。
1861 1 10月20日，清政府設立總理外事辦公室，企圖“建立多部制”。在丞相府設立之前，清廷的外交事務由禮部、藩屬部、紅殿等機構負責，丞相府將分散在這些部門的外交權力集中起來。從此，清朝有了專門的外交機構。起初，總理辦公室只負責外交、貿易和關稅。後來逐漸擴展到鐵路、采礦、火器和武器制造，成為主要部門。戊戌變法光緒年間，刑部郎沈重在追悼會上說:“這是丞相衙門的事。其中六個不僅復雜，而且全面。”1901總理府外務省改名為外務省，還是“六年前”。
事實上，在《預備立憲制》公布之前，清朝已經在1898、1901、1903、1905進行過小規模的機構改革，但此時的零敲碎打的改進對於岌岌可危的晚清政權是無濟於事的。實際上，在戊戌變法期間，光緒皇帝就頒布了將太常寺、光祿寺、洪松寺納入禮部的措施，但直到1906才付諸實施。
8月30日1998由於“舊系統”，
康有為雖然也認為光緒皇帝的這壹不同尋常的舉動是“化政治為勇氣”，但還是覺得有點突然。康有為說:“我壹直在講改革官制，但主要是加新，不是減舊。”他堅持采取新舊共存的溫和政策。連梁啟超都覺得“裁官最難”
那麽，光緒皇帝為什麽要采取如此不同尋常的措施呢？起初，光緒於6月11日頒布明定國聖旨，宣布實行變法，但到了8月，變法顯然處於十字路口，遇到了很大阻力。例如，光緒應該整頓官僚機構，並杜絕“在工作中強奸官員和專業人士。”7月29日，他下令衙門砍掉繁瑣的管理事務的條條框框，另立新章。因此，衙門拒絕“以無案可援為借口亂報”。
因此，光緒皇帝想從裁撤合並閑置機構和冗員入手，打擊頑固保守勢力，同時鏟除壹些保守官員的活動據點。據記載，光緒八月三十日法令頒布時，“老臣哭到墻角。”改革落馬以來從未實施過“新政”二字的廣東省省長；隨後，懷特海等6名禮部高官被光緒皇帝革職。
科舉改革是清朝光緒年間戊戌變法後，對朝廷政治管理制度的改革。戊戌變法失敗，隨後的“部制”改革自然失敗。有很多慘痛的教訓值得深思。總結起來，主要有三個教訓:
第壹，光緒的“部制”改革過於草率。
這個改革太草率了。在百日維新的103天中，光緒皇帝先後頒布了約108條改革法令，平均每天1.7條。數量最多的是9月12日，壹天頒布了11條改革法令。光緒皇帝的這壹舉動雖然體現了他“觀時務，自強不息”的迫切心情，但也留下了改革過於倉促的後遺癥。
1898年8月30日，廢除衙門，裁減冗員的聖旨下達。目前，中國第壹歷史檔案館收錄了《朱蓋聖旨》，全文以清誌記載。可見光緒皇帝對軍機起草的政令並不滿意。除了壹些圈出來的字，還有田寫的字。在官員起草的法令中，這是用詞最多的壹條。其中，光緒皇帝嚴格規定了部門合並的完成日期，朱碧天“將預演限定在壹個月之內，似欲消滅此權力，並逐步充實少量經費，從而擴大新規定”。光緒皇帝對朱碧的限制表明了他對新政的焦慮。
第二，機構改革缺乏事前規劃和事後補救措施。
8月30日，光緒下令廢除詹世福衙門、鄭桐使者、太常寺、光祿寺和紅紅寺。然而，相關職能的移交沒有提前完成。1年9月，他指示將被廢除的政府辦公室的所有事務合並為6個內閣辦公室。合並的具體事務，由大學士、六部尚書、侍郎五日內辦理。但顯然，在五天之內，大學士和六位官員未能拿出具體可行的方案，於是在10年9月，光緒下令大學士和六位大臣、侍郎、巡撫盡快提出方案。崖門已經宣布取消10天，但是目前還沒有具體的合並方案。由此產生的權力其實是空虛的，這無疑給守舊勢力提供了把柄。
第三，對被裁撤的官員沒有妥善的安置方案。
9月8日，光緒皇帝頒布法令，規定裁員可以由路礦總局和農工商總局決定，以後再作任命。不久，壹場政變發生，光緒皇帝的“大體制”願望破滅。當然，裁員是當務之急，但如果處理不當，也會給那些對改革持懷疑態度的人增加更多阻力。這是幾萬甚至幾十萬條人命的事。光緒事前沒有深思熟慮，事後也沒有及時想到可行的補救辦法。當時在中國海關稅務總署工作的英國人赫德說:“皇帝的指示是正確的，但他的顧問康有為等人缺乏工作經驗。他們只是用善良扼殺進步。他們放了足夠吃九年的食物，不考慮他胃的大小和消化能力，三個月之內就把他塞進去了，所以他暫時被勒死了。”
其實清末政府腐敗，官場黑暗，百姓生活貧困，弊端很多。無論是戊戌變法，還是“大壹統”改革，都無法改變清朝的命運。