電子普通發票的稅率有四檔：3%、6%、10%、16%。壹般納稅人和小規模納稅人開具電子普通發票時不能用於抵扣進項稅。小規模納稅人應按3%稅率征收增值稅。壹般納稅人開具電子普通發票需按適用稅率計算銷項稅額。
電子普通發票的使用場景：
1、適用於增值稅壹般納稅人和小規模納稅人之間的交易；
2、可用於銷售商品、提供勞務、服務和無形資產；
3、適合於電子商務平臺交易；
4、可以用於企業間的日常采購和費用報銷；
5、適用於需要即時開票的場合，如餐飲、零售等。
6、在政策允許的範圍內，可替代紙質普通發票使用。
綜上所述，電子普通發票的稅率分為3%、6%、10%和16%四個檔次，其中小規模納稅人應使用3%稅率並且不能用於抵扣進項稅，而壹般納稅人則需根據適用稅率開具電子普通發票並計算銷項稅額。
法律依據：
《營業稅改征增值稅試點實施辦法》
第十五條
（壹） 納稅人發生應稅行為，除本條第（二）項、第（三）項、第（四）項規定外，稅率為6%。
（二） 提供交通運輸、郵政、基礎電信、建築、不動產租賃服務，銷售不動產，轉讓土地使用權，稅率為11%。
（三） 提供有形動產租賃服務，稅率為17%。
（四） 境內單位和個人發生的跨境應稅行為，稅率為零。具體範圍由財政部和國家稅務總局另行規定。
第十六條
增值稅征收率為3%，財政部和國家稅務總局另有規定的除外。