1965438+2009年5月31日，經中華民國稅務總局批準，關閉東澳海關。
1939年2月，日軍入侵，東澳島淪陷。日軍在當地強奸、掠奪、殺害平民。
8月1945日，日本正式投降。東澳島的收復。(東澳島當時屬中山縣管轄)
1950 5月31日淩晨2時，在萬山群島海戰中，中國人民解放軍成功解放東澳島。
1986期間，東澳島南沙灣發掘出新石器時代石網墜、帶砂陶斧、青銅時代銅斧、北宋雕花碗、明清瓷器殘片等。說明在3000多年前的夏商時期，人們就在東澳島居住。
1994年5月，設立東澳旅遊綜合開發實驗區，行使鎮級管理權限，轄東澳、黃毛、黃白、大榭、小榭島等6個島嶼和小蒲臺島，常住人口600余人。
2003年，東澳水庫建成，庫容6萬立方米，總投資600萬元。在此之前，東澳島沒有自來水供應，所有的水都是居民用山泉水、大水坑、水庫水、大井水連接起來下山飲用。沒有消毒和凈化，水質就無法保證。水庫建成後，島上軍民可以通過自來水管道獲得幹凈安全的自來水。
2009年，興業太陽能利用金太陽補助資金在東澳島投資建設了約1 MW的“風光儲柴”離網獨立供電系統。島上首次實現24小時供電，島上居民開始正常使用電視、冰箱、空調等現代化家用電器。在此之前，島上因為沒有電力供應，晚上壹片漆黑，生活相當原始。直到1987才開始用柴油發電，但是汙染嚴重，電壓不穩定，平均每天用電不到兩個小時。
2011年，格力集團投資26億元正在建設的東澳島紀靈海岸將成為中國的“巴厘島”，紀靈沿岸將建設5家主題酒店。即將開工的東澳島高檔酒店及旅遊開發項目，目前正在有序推進。壹期將投資3億元在南沙灣建設壹座面積3.5萬平方米、建築面積約3.6萬平方米的高檔旅遊酒店。
2065438+2004年5月01日，珠海秦恒島至東澳島的定期航班開始首航。
2065438年6月11日，深圳重啟珠海蛇口至東澳島定期航班，並於當日起航。
2065438+2004年6月20日，來自法國的全球最大度假連鎖CLUB MED在東澳島南沙灣開業。(內部試運行)