分公司是總公司的分支機構。與子公司不同，子公司具有獨立法人地位，需要獨立核算，自行申報。非獨立核算的分支機構不是獨立核算的納稅人，其財務納入總公司統壹核算管理。需要建立相關的輔助賬戶和明細賬戶，根據總行要求確定。
壹、規定分支機構單獨納稅申報
在總機構和分支機構在同壹個地方和轄區的情況下，可以由總機構統壹納稅申報。如果不在同壹地區，那麽根據屬地原則，分支機構應在其所在地單獨申報。
1，稅務登記等。應在領取營業執照後30日內辦理稅務登記。
是否應該征收國稅，取決於妳的企業所得稅是國稅征收還是地稅征收:如果是國稅，就應該征收國稅；地稅的話，要看經營項目。如果營業稅是主體稅種，就只辦理地稅。如果增值稅是主體稅，就辦理國稅。
2.申報納稅。視稅而定。
營業稅在勞務發生地繳納；企業所得稅由總機構申報；由扣繳義務人代為扣繳的個人所得稅，由支付工資的機構代扣代繳。
3.目前來看，做不做獨立核算都無所謂。該匯總繳納的(企業所得稅)匯總繳納，該當場繳納的(營業稅)當場繳納。個人所得稅可以就地繳納，也可以集體繳納，也可以不經批準就地繳納。
4.建賬:分支機構和總公司可以通過兩種方式進行核算:
(1)壹是獨立核算，即設立單獨賬戶，對分公司的業務經營過程和結果進行全面系統的核算。
特點是:管理上有獨立的組織形式，有壹定的資金，在當地銀行開戶；獨立開展業務活動，能夠與其他單位簽訂經濟合同；獨立核算盈虧，設置獨立的會計機構，配備會計人員，有完整的會計工作組織體系；
(2)非獨立核算，也稱報賬制，是指按日或定期向上級單位報送與本單位業務活動有關的日常業務數據，由上級單位進行核算。其特點是壹般由上級撥出壹定數額的流動資金從事經營活動，所有收入全面上繳，所有費用向上級報銷。損益不單獨計算，只記錄和計算幾個主要指標進行簡單核算。
5.申報:如果總公司和分公司在同壹個地方，同壹個轄區，總公司可以統壹報稅。如果不在同壹個地區，那麽根據屬地原則，分支機構應該在其所在地單獨報稅。
二、分公司獨立核算如何申報納稅
1.先去銀行開個扣稅賬戶，再去稅務所備案。以後妳只需要在網上申報他會自動從銀行扣款，所以妳壹定要保證扣稅賬戶有足夠的錢扣款。
2.增值稅是按月申報的(IRS)，不管有沒有收入都要申報。申報期壹般在每月15之前，如有法定節假日順延。
3.如果是按季預繳企業所得稅，(因為妳問的是增值稅，我覺得妳的企業所得稅也應該在國稅繳納)，壹般是在季度後的壹個月之前(4月15，7月15等)。).
第三，分公司如何納稅
分公司的流轉稅必須由當地稅務機關計算繳納，這是流轉稅的基本原則。也就是申報繳納地稅。目前基本上所有城市的國稅和地稅報稅都是在線的。尚未開展網上申報的公司，可持稅務登記證(正、副本)營業執照、銀行基本賬戶開戶許可證、銀行基本賬戶開戶資料等證件向當地稅務機關申請網上納稅申報。
法律依據
中華人民共和國企業所得稅法
第二十二條企業的應納稅所得額乘以適用稅率，減除依照本法稅收優惠規定減征或者抵免的稅額後的余額，為應納稅額。
第二十三條企業取得的下列所得在境外繳納的所得稅稅款，可以從其當期應納稅額中扣除，抵免限額為依照本法規定計算的應納稅額；超過信用額度的部分可在未來五年內用年度信用額度抵扣當年應納稅款後的余額進行抵扣；
(壹)居民企業從中國境外取得的應納稅所得；
(二)非居民企業在中國境內設立機構、場所，取得發生在中國境外但實際與該機構、場所有關的應納稅所得。