以及《中華人民共和國財政部國家稅務總局關於將鐵路運輸和郵政業納入營業稅改征增值稅試點的通知》(財稅[2065 438+03]106號)通知附件1《營業稅改征增值稅實施辦法》第四十二條規定:“總機構和分支機構不在同壹縣(市)的，應當向各自所在地主管稅務機關申報。經中華人民共和國財政部、國家稅務總局或其授權的財政稅務機關批準，總機構可以向總機構所在地主管稅務機關匯總申報納稅。
根據《中華人民共和國財政部國家稅務總局關於固定業務總支機構征收繳納增值稅有關政策的通知》(財稅[2012]9號)“固定業務總支機構不在同壹縣(市)，而是在同壹省(區、市)內的，由該省(區、市)財政廳(局)批準。從上述規定來看，分支機構實現的增值稅，原則上應在分支機構所在地申報繳納。
納稅人選擇匯總繳納增值稅的，跨省分支機構應當取得中華人民共和國財政部和國家稅務總局的批準；同壹省(區、市)內分支機構繳納的稅款，由該省(區、市)財政廳(局)、國家稅務局核定；總機構在同壹縣(市)設有分支機構的，總機構可以向主管稅務機關申請匯總繳納增值稅。但是匯總繳納增值稅並不意味著所有分支機構都不需要當場預繳增值稅。
根據《財政部國家稅務總局關於重新印發〈總機構試點納稅人增值稅計算繳納暫行辦法〉的通知》(財稅[2013]74號)，分支機構發生《應稅服務範圍註釋》所列業務的，按照適用的增值稅銷售額和扣繳率計算繳納增值稅。
分行匯總支付的特殊情況。《中華人民共和國國家稅務總局關於通過資金結算網絡征收貨物增值稅納稅人納稅地點的通知》(國〔2002〕802號)規定，納稅人以總機構的名義在各地開立賬戶，通過資金結算網絡向各地購貨方收取銷售款項，由總機構直接向購貨方開具發票。收款機構未按《中華人民共和國國家稅務總局關於企業機構間轉讓貨物征收增值稅的通知》的規定向買方開具發票或向買方收取貸款的，其應納稅所得額應在其總機構所在地繳納增值稅。根據上述規定，分支機構以總公司的名義開戶，其取得的銷售收入應在總公司所在地納稅。
2.分支消費稅的納稅地點。消費稅是中央稅種。《中華人民共和國消費稅暫行條例實施細則》(中華人民共和國財政部、國家稅務總局令第51號)規定，總機構和分支機構不在同壹縣(市)的納稅人，應當向各自機構所在地的主管稅務機關申報納稅；經中華人民共和國財政部、國家稅務總局或其授權的財政稅務機關批準，總機構可以向總機構所在地主管稅務機關匯總申報納稅。
《中華人民共和國財政部國家稅務總局關於消費納稅人壹般分支機構征收繳納消費稅有關政策的通知》(財稅[2012]42號)規定，納稅人的總機構和分支機構不在同壹縣(市)，但在同壹省(自治區、直轄市)內，並經所在省(自治區、直轄市)財政廳(局)和國家稅務局批準，
可以看出，總支機構消費稅納稅地點與增值稅相同:總支機構消費稅納稅地點原則上應在各自機構所在地，跨省分支機構匯總納稅應經中華人民共和國財政部、國家稅務總局批準；同壹省(區、市)內分支機構繳納的稅款，由該省(區、市)財政廳(局)、國家稅務局核定；總機構在同壹縣(市)設有分支機構的，總機構可以向主管稅務機關申請匯總繳納增值稅。
3.分公司營業稅的納稅地點。營業稅屬於中央，除了鐵道部、銀行、保險公司繳納的部分，其余屬於地方政府。《中華人民共和國營業稅暫行條例》(國務院令第540號)第十四條規定，納稅人提供應稅勞務，應當向其機構所在地或者居住地的主管稅務機關申報納稅。但是，納稅人提供的建築勞務和國務院財政、稅務主管部門規定的其他應稅勞務，應當向應稅勞務發生地主管稅務機關申報繳納。
納稅人轉讓無形資產，應當向其機構所在地或者住所地主管稅務機關申報納稅。但是，納稅人轉讓或者出租土地使用權的，應當向土地所在地的主管稅務機關申報納稅；納稅人銷售或者出租不動產，應當向不動產所在地的主管稅務機關申報納稅。土地、房地產和應稅服務的位置很好理解。“機構所在地”包括分行嗎？有繳納營業稅義務的單位，是指有應稅活動，收取貨幣、貨物或者其他經濟利益的單位，但不包括納稅人依法不需要辦理稅務登記的內設機構。
所謂依法不需要辦理稅務登記的機構，實際上是指行政事業單位或企業內部機構，但上述單位或機構有應稅營業稅的，也應繳納營業稅，其單位所在地也是營業稅中提到的機構所在地。因此，營業稅所說的機構所在地，是指依法應當辦理稅務登記的機構所在地。《中華人民共和國稅收征收管理法》第十五條規定:“企業、企業在外地和從事生產經營的場所設立的分支機構、個體工商戶和從事生產經營的機構，應當自領取營業執照之日起三十日內，持有關證件向稅務機關申報辦理稅務登記。
《中華人民共和國稅收征收管理法實施細則》第十二條規定:“從事生產經營的納稅人，應當自領取營業執照之日起30日內，向其生產經營地或者納稅義務發生地的主管稅務機關申請辦理稅務登記，如實填寫稅務登記表，並按照稅務機的要求提供有關證件、資料。”《稅務登記管理辦法》第二條規定:“企業、企業在外地設立的分支機構、從事生產經營的場所、個體工商戶和從事生產經營的機構，應當依照稅收征管法、實施細則和本辦法辦理稅務登記。
《國家稅務總局關於完善稅務登記管理的通知》(國稅發〔2006〕37號):“稅務登記的範圍和管理。按照稅收征管法及其實施細則和稅務登記管理辦法的有關規定，除國家機關、個人(自然人)和無固定生產經營場所的農村流動攤販外，納稅人應當辦理稅務登記。”從稅務登記管理的角度來說，分支機構具備納稅人的全部生產經營條件，理應辦理稅務登記，當然也是營業稅納稅人。
分公司的生產經營收入由公司總部統壹結算，在分公司收取。即分公司通過生產經營活動取得了經濟利益，產生了應納的營業稅收入。但由於內部核算和風險防範的要求，應稅收入被人為地集中在總部，但收入歸屬的性質和地點並沒有改變。綜上所述，企業的分支機構應該是營業稅的納稅人，納稅地點應該是稅務登記地，與企業收入的具體核算地點無關，無論是獨立的還是非獨立的。
需要註意的是，分支機構應當向應稅勞務發生地、土地或者不動產所在地的主管稅務機關申報納稅，但自應當申報納稅的月份起超過六個月未申報納稅的，由其總機構所在地的主管稅務機關補稅。
因為營業稅屬於地方收入，在同壹縣(市)設立的總支機構有權決定是否征收和繳納。如《深圳市地方稅務局關於發布行政審批實施辦法的公告》(深地稅報[2065 438+02]7號)規定，符合下列條件的，總支機構可以申請匯總繳納營業稅: (壹)總支機構全部位於深圳的；(二)申請匯總納稅的總機構具有法人資格；(三)申請匯總納稅的分支機構不具備法人資格；(四)稅務登記資料已在總機構和分支機構登記；(5)采用連鎖經營模式，所有分店均為直營店(即連鎖店由總部全資擁有，在總部領導下經營)；(六)分支機構不設財務人員，實行非獨立核算；(七)對產品實行統壹采購和配送，統壹核算，統壹管理和經營；(8)所有收入應存入總公司銀行賬戶，所有成本和費用由總公司支付；(九)由總行統壹購買發票。
4.分公司企業所得稅的納稅地點。現行企業所得稅法實行的是企業所得稅制。根據公司法的規定，分公司不具有法人資格，但需要在當地辦理工商登記和稅務登記。因此，分公司不是獨立的企業所得稅納稅人。
根據《中華人民共和國國家稅務總局關於印發〈跨地區經營匯總繳納企業所得稅管理辦法〉的公告》(國家稅務總局公告第57號，2012)，居民企業在中國境內跨地區(指省、自治區、直轄市和計劃單列市，下同)設立不具有法人資格的分支機構的，除另有規定外，實行“統壹計算、分級管理、就地預繳。所謂“就地預繳”，是指總機構和分支機構應按月或按季向當地主管稅務機關申報預繳企業所得稅。
中華人民共和國國家稅務總局公告2012第57號也規定，居民企業未在中國境內跨地區設立不具有法人資格的分支機構，僅在同壹省、自治區、直轄市和計劃單列市(以下簡稱同壹地區)設立不具有法人資格的分支機構的， 企業所得稅征收管理辦法，由各省、自治區、直轄市和計劃單列市國家稅務局、地方稅務局參照本辦法共同制定； 居民企業在中國境內跨地區設立不具有法人資格的分支機構，在同壹地區內設立不具有法人資格的分支機構的，其企業所得稅征收管理按照跨省的規定執行。
根據《財政部、國家稅務總局關於印發〈跨省總機構企業所得稅分配和預算管理暫行辦法〉的通知》(財預[2012]40號)等相關文件規定，以下八家分支機構無需預繳企業所得稅:
1.垂直管理的中央企業分支機構不需要預繳企業所得稅。2.三級及以下分支機構不在當地預繳企業所得稅，其營業收入、員工工資和資產總額統壹計入二級分支機構。3.當分支機構沒有獨立生產經營的職能部門時，沒有獨立生產經營的職能部門不就地預繳企業所得稅。4.不具備主要生產經營功能且不在當地繳納增值稅和營業稅的企業的二級及以下分支機構，如產品售後服務、內部研發、倉儲等。，不在當地預繳企業所得稅。5.上壹年度被認定為小型微利企業的，其分支機構不就地預繳企業所得稅。6.新設立的分支機構不在設立當年預繳企業所得稅。7.被撤銷的分支機構，當年剩余期間應繳納的企業所得稅由總機構繳入中央國庫。8.不具有法人資格的企業在中國境外設立的營業機構，不得就地預繳企業所得稅。
需要註意的是，根據企業所得稅法規定，企業所得稅不再對分公司或不具有法人資格的分支機構單獨繳納，而是由總公司壹次性繳納，但分公司應根據總公司的所得稅明細表就地預繳企業所得稅。總機構不提供分配表的，分公司應當按照取得的利潤在分公司所在地全額繳納企業所得稅。
五、支薪個人所得稅的繳納地點。《中華人民共和國個人所得稅法》第八條規定“以支付所得的單位或者個人為扣繳義務人”。這壹條款包含以下兩個關鍵點:第壹，個人所得稅扣繳義務的前提是支付個人收入，通俗地說就是給員工發工資；第二，扣繳義務人所在地的地方稅務機關是個人所得稅征收管理機關。
企業給分支機構撥款，只能說明分支機構員工的收入是企業提前支付的，並不代表支付，不存在代扣代繳個人所得稅的問題。分公司員工的工資收入由分公司支付。顯然，分支機構是員工個人所得稅的扣繳義務人，自然分支機構的地方稅務機關成為該企業員工個人所得稅的征管機關。因為個人所得稅是地方稅，各地實際執行的規模不壹。如廣東省東莞市地稅局要求分支機構的個人所得稅在分支機構所在地繳納。選擇在總機構所在地稅務機關繳納的，需要向分支機構所在地稅務機關提交匯總申請。
對於異地從事建築安裝工程作業的單位，原來規定在工程作業所在地代扣代繳個人所得稅。但在單位所在地分配所得，並能向主管稅務機關提供完整、準確的會計賬簿和憑證的，經主管稅務機關核準後，可回單位所在地扣繳個人所得稅。現行政策即《中華人民共和國國家稅務總局關於建築安裝工人跨省個人所得稅征收管理的公告》(中華人民共和國國家稅務總局公告第52號，2015)規定，所有異地施工企業的個人所得稅均由扣繳義務人向項目所在地稅務機關申報繳納。
6.分公司印花稅的納稅地點。根據《中華人民共和國印花稅暫行條例實施細則》第十四條第壹款規定，納稅人應當在簽訂合同時、建檔時、開立賬簿時、領取許可證時申請貼花。所以印花稅壹般在本地繳納。根據《中華人民共和國國家稅務總局關於在訂貨會上簽訂的合同繳納印花稅地點的通知》(國發[1991]第1187號)的規定，在全國商品物資訂貨會(包括展銷會、交易會)上簽訂的合同，應繳納的印花稅，由納稅人回所在地後及時辦理；在地方舉辦的訂貨會和交易會上簽訂的不涉及省際關系的合同的印花稅，由各省、自治區、直轄市人民政府確定。
七、分支機構資源稅繳納地點。根據《中華人民共和國資源稅暫行條例》(國務院令第605號)，納稅人應繳納的資源稅，向應稅產品開采地或者生產地的主管稅務機關繳納。納稅人在本省、自治區、直轄市範圍內開采或者生產應稅產品，需要調整納稅地點的，由省、自治區、直轄市稅務機關決定。
《中華人民共和國資源稅暫行條例實施細則》(財政部令第66號)規定，扣繳義務人代扣代繳的資源稅，應當向收購地主管稅務機關繳納；納稅人跨省、自治區、直轄市開采或者生產資源稅應稅產品，其下屬生產單位和核算單位不在同壹省、自治區、直轄市的，應當在開采或者生產地就其開采或者生產的應稅產品納稅。對實行定量評估的應稅產品，應納稅額由獨立核算單位根據各開采地或生產地的銷售額和適用稅率計算分攤；對實行從價計稅的應稅產品，應納稅額由獨立核算單位根據各開采地或生產地的銷售量、單位銷售價格和適用稅率計算分攤。