1、在兩個以上單位任職受雇並領取工資薪金，預繳稅款時重復扣除了基本減除費用（5000元/月）；
2、除工資薪金外，還有勞務報酬、稿酬、特許權使用費，各項綜合所得的收入加總後，導致適用綜合所得年稅率高於預扣率；
3、預扣預繳時扣除了不該扣除的項目，或者扣除金額超過規定標準，年度合並計稅時因調減扣除額導致應納稅所得額增加；
4、納稅人取得綜合所得，因扣繳義務人未依法申報收入並預扣預繳稅款，需補充申報收入。
個人所得稅匯算清繳的步驟：
1、確定所得種類：在進行個稅匯算清繳之前，首先需要明確自己的所得種類。根據中國稅法，個人的所得種類包括工資薪金所得、勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得、財產租賃所得、財產轉讓所得、利息、股息紅利所得、偶然所得和其他所得等；
2、收集個稅繳納證明：個人在進行個稅匯算清繳之前，還需要準備好個稅繳納證明。個人可以通過工資單、銀行對賬單、證券賬戶流水單等途徑獲取個稅繳納證明；
3、計算應納稅所得額：應納稅所得額是指個人全年的收入減去各項扣除後的金額。在計算應納稅所得額時，個人需要註意各項扣除的具體金額和條件；
4、根據稅率表計算稅款：個人所得稅稅率表是根據稅法制定的，根據應納稅所得額和稅率表，可以計算出個人需要繳納的個人所得稅；
5、繳納個人所得稅：個人在計算出需要繳納的個人所得稅後，需要向稅務機關繳納相應的稅款。在繳納個人所得稅時，需要註意繳納方式、繳納時間以及繳納地點等細節問題。
法律依據：
《中華人民***和國個人所得稅法》第十三條
納稅人取得應稅所得沒有扣繳義務人的，應當在取得所得的次月十五日內向稅務機關報送納稅申報表，並繳納稅款。
納稅人取得應稅所得，扣繳義務人未扣繳稅款的，納稅人應當在取得所得的次年六月三十日前，繳納稅款；稅務機關通知限期繳納的，納稅人應當按照期限繳納稅款。
居民個人從中國境外取得所得的，應當在取得所得的次年三月壹日至六月三十日內申報納稅。
非居民個人在中國境內從兩處以上取得工資、薪金所得的，應當在取得所得的次月十五日內申報納稅。
納稅人因移居境外註銷中國戶籍的，應當在註銷中國戶籍前辦理稅款清算。