壹是平時有專項附加扣除，其他扣除不在代扣代繳階段申報，而是在年度匯算清繳時申報。
二是僅勞務報酬、特許權使用費所得，且上述所得壹般不超過30萬元，無工資收入或工資收入很少的自然人，扣繳、預繳稅率較高，稅率較低的自然人，全年綜合計算。
第三，工資待遇不平衡。如果上月工資高，下月工資低或者沒有工資薪金收入，則全年綜合計算不需要繳納個人所得稅的自然人。
四是年工資薪金所得總額不足654.38+0.2萬元，因勞務報酬等因素已預繳個人所得稅的納稅人代扣代繳。
法律依據:《中華人民共和國稅收征收管理法》
第五十壹條納稅人多繳稅款，稅務機關發現後，應當立即退還；納稅人自匯算清繳稅款之日起三年內發現的，可以請求稅務機關退還多繳稅款並加計銀行同期存款利息，稅務機關及時核實後應當立即退還；涉及退庫的，應當依照有關國庫管理的法律、行政法規的規定退還。
第五十二條因稅務機關的責任造成納稅人、扣繳義務人未繳或者少繳稅款的，稅務機關可以要求納稅人、扣繳義務人在三年內補繳稅款，但不加收滯納金。
納稅人、扣繳義務人因計算錯誤等原因未繳或者少繳稅款的，稅務機關可以在三年內追繳稅款和滯納金；在特殊情況下，征兵期限可以延長到五年。
對偷稅、抗稅、騙稅的，由稅務機關追繳未繳或者少繳稅款、滯納金或者騙稅，不受前款規定期限的限制。