個人所得稅退稅的時間限制確實是在每年的3月1日至6月30日之間。在這個時間段內，納稅人需要完成年度的匯算清繳工作。如果在預繳稅款過程中存在多繳的情況，或者有符合條件的專項附加扣除未能扣除，或者因為就業、退職等原因導致稅收優惠政策變動，以及勞務報酬、稿酬等預扣預繳稅率高於應納稅額的情況，納稅人都可以在規定時間內向稅務機關提出退稅申請。
個人所得稅退稅申請的步驟：
1. 準備相關資料：包括身份證明、稅務登記證、工資薪金收入證明、已繳稅款憑證等。
2. 提交申請：向任職單位或扣繳義務人提出退稅申請，並提供上述相關資料。
3. 單位或扣繳義務人審核：審核納稅人提供的信息和資料是否齊全、準確。
4. 向稅務機關報送申請：由單位或扣繳義務人將退稅申請及相關資料報送至主管稅務機關。
5. 稅務機關審核：稅務機關對退稅申請進行審核，確認退稅金額。
6. 辦理退稅：審核通過後，稅務機關按照國庫管理的有關規定辦理退稅。
綜上所述，個人所得稅申請退稅的時間限制是在3月1日到6月30日期間進行匯算清繳。在這個時間段內，納稅人需要準備相關資料並向任職單位或扣繳義務人提交退稅申請。
法律依據：
《稅收征收管理法實施細則》
第七十八條
稅務機關發現納稅人多繳稅款的，應當自發現之日起10日內辦理退還手續；納稅人發現多繳稅款，要求退還的，稅務機關應當自接到納稅人退還申請之日起30日內查實並辦理退還手續。稅收征管法第五十壹條規定的加算銀行同期存款利息的多繳稅款退稅，不包括依法預繳稅款形成的結算退稅、出口退稅和各種減免退稅。退稅利息按照稅務機關辦理退稅手續當天中國人民銀行規定的活期存款利率計算。