1、兩者經營場所不同。
有限公司必須有自己固定的經營場所及從業人員，而個體工商戶沒有限制，從事客貨運輸、販運以及擺攤設點、流動服務的個體工商戶無須固定的經營場所。
2、兩者投資主體不同。
有限公司投資主體是法人，個體工商戶投資主體只能是自然人。
3、兩者稅收區別在個體戶收營業稅（按月營業額的4%到6%）月營業額低於五千元不收，利潤按個人所得稅征收，有限公司在營業稅方面壹樣，在所得稅方面不壹樣，征收企業所得稅，稅率比較高（24%到33%）。
4、兩者開票權限不同。
個體戶不能直接開發票，要到當地稅務所代開，有限公司在進行小額納稅人登記以後可以自己開發票。
5、兩者的清算程序不同。
有限公司解散，由投資人自行清算或者由債權人申請人民法院指定清算人進行清算。而個體工商戶歇業時無清算程序，只需向原登記機關辦理歇業手續，繳銷營業執照。
擴展資料：
在依法核準登記的範圍內，個體工商戶享有從事個體工商業經營的民事權利能力和民事行為能力。個體工商戶的正當經營活動受法律保護，對其經營的資產和合法收益，個體工商戶享有所有權。
個體工商戶從事生產經營活動必須遵守國家的法律，應照章納稅，服從工商行政管理。個體工商戶從事違法經營的，必須承擔民事責任和其他法律責任。
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