壹是當前銀行業在信息技術系統改造、業務與稅務協調、因營改增實施帶來的流程轉型等方面的困難和影響。
1.在信息技術系統改造方面，銀行業確實面臨著比其他行業更高的改造成本，因為銀行業涉及的系統改造範圍很廣。只要與收入相關的系統，包括利息收入、中間業務收入、同業收入等。，都得轉型，銀行信息技術的廣泛采用無疑需要大量的軟硬件投入，尤其是營改增後，還有很多功能應用需要進壹步完善，軟件環境需要不斷升級。
2.實現業務與稅務的協調銜接:改革後，銀行必須建立增值稅開票系統與現有業務系統的有效銜接，解決銜接過程中的軟硬件問題，還需要制定相應的增值稅開票流程，規範工作人員的業務行為，防範風險。目前銀行缺乏稅務人才，更看重業務和信貸專家。未來在實施“營改增”的過程中肯定需要專職稅務人員，新崗位的崗前培訓和人力成本也是很大的支出。
3.流程轉型:營改增後，銀行業需要從稅務設計及其征管向銀行的技術系統和業務流程轉型。按照5月1營改增落地的要求，最大的挑戰是細則沒有出臺，導致政策的不確定性和改革成本的不可逆性之間的矛盾。但如果等待政策出臺，可能無法及時完成營改增的實施，對我們的業務和客戶都會有很大的影響。因此，商業銀行只能依靠自己掌握的信息，結合增值稅的基本原理來探索前進的道路，但壹旦政策出臺，很可能會造成壹些成本的下沈。
二、營改增後，適用稅率變化引起的稅收負擔和進項抵扣問題。
1.適用稅率變化對稅負的影響:目前金融保險業營業稅稅率為5%，其應稅營業額包括貸款業務收入、差價業務收入和中間業務收入。在這三項業務中，貸款業務收入是銀行業務收入的主要內容，營業稅作為價內稅，以其金融業務的業務收入全額為計稅依據。“營改增”後，財稅部門正在考慮對金融保險業采用6%的增值稅稅率。因為增值稅是價外稅，其計稅依據首先要換算成不含稅的收入。因此，雖然利率提高了1%，但相應的計稅基礎也降低了。
2.進項稅抵扣對稅負的影響:“營改增”後，相關進項稅也可以抵扣。銀行可以抵扣的進項稅主要包括以下幾個方面:
(1)其經營的電子設備、辦公設備、櫃臺等固定資產的采購；
(2)銀行信息技術系統所需的硬件和軟件支出。盡管存在上述可抵扣的進項稅額，但在實際業務中，由於無法取得增值稅專用繳款書，更多的成本將無法抵扣。不能抵扣的進項稅額主要體現在以下幾個方面:(1)支付給個人的存款利息；(2)銀行員工的勞動支出。
因此，在日常業務中，銀行業需要加強會計核算，降低銀行的稅收成本和增加進項稅額，以加強增值稅抵扣，減輕稅負。
三、營改增後，對銀行業務和內控管理風險的影響。
1，業務改革對業務的影響
因為營改增可能會降低部分企業貸款的稅收成本，因為這些借款人的貸款利息可以在銀行的進項稅中抵扣，營改增後收入價格稅分離，滿足了下遊主體抵扣進項稅的需求，有利於提高金融業服務實體經濟的能力。同時，下遊主體通過抵扣進項稅降低經營成本，有利於銀行信貸環境的反向改善和貸款業務的穩定增長。
2.營改增對內控管理風險的影響
給個人客戶開發票也有問題。營業稅下，銀行不給客戶提供發票，但營改增後，個人客戶會要求銀行提供增值稅普通發票。開具這些海量發票的需求，大大增加了商業銀行的負擔和工作量。外部監管的挑戰在於，除了原有的大企業風險管理和重點稅源監控，營改增後銀行有望面臨增值稅的風險納稅評估，還要配合增值稅專用發票的檢查。如果存在違法行為，可能會涉及刑事責任等風險和挑戰。
總而言之，稅率從5%提高到了6%。在沒有細則的情況下，以上分析判斷都是根據可能推斷出的結果，壹切都需要等待細則的落地。