壹、了解實收資本余額的原因
在公司註銷過程中，如果發現實收資本存在余額，首先需要了解余額產生的原因。這可能包括未分配利潤、股東投入資金超過註冊資本的部分、或者因匯率變動導致的資本差異等。了解原因有助於選擇合適的處理方式。
二、查閱公司章程和法律法規
公司章程是公司內部管理的基石，其中往往規定了公司註銷時實收資本余額的處理方式。此外，相關法律法規如《公司法》、《企業破產法》等也對公司註銷時的財務處理有明確規定。因此，處理實收資本余額時，必須仔細查閱公司章程和相關法律法規，確保操作的合規性。
三、與股東協商處理方案
實收資本余額的處理涉及股東權益，因此必須與股東進行充分溝通，協商處理方案。處理方式可能包括將余額分配給股東、用於償還公司債務、或者轉入其他合法用途等。在協商過程中，應充分尊重股東的意願，確保處理方案的公平性和合法性。
四、履行相關程序
確定了實收資本余額的處理方案後，需要按照公司章程和相關法律法規的規定，履行相關程序。這可能包括召開股東大會或董事會會議，審議並批準處理方案；編制相關財務報表和清算報告，報送有關部門審核；以及辦理稅務、工商等註銷手續等。
五、註意風險防範
在處理實收資本余額的過程中，還需要註意風險防範。例如，應確保處理方案的合法性，避免涉及非法集資、洗錢等違法行為；同時，也要關註稅務風險，確保處理過程符合稅法規定，避免因稅務問題導致不必要的麻煩。
綜上所述：
公司註銷時實收資本存在余額，應首先了解余額產生的原因，查閱公司章程和相關法律法規，與股東協商處理方案，並按照規定的程序進行操作。在整個過程中，要註意風險防範，確保處理的合規性和有效性。
法律依據：
《中華人民***和國公司法》
第壹百八十六條規定：
公司清算時，清算組應當根據清算方案，以公司財產分別支付清算費用、職工的工資、社會保險費用和法定補償金，繳納所欠稅款，清償公司債務後的剩余財產，有限責任公司按照股東的出資比例分配，股份有限公司按照股東持有的股份比例分配。
《中華人民***和國企業破產法》
第壹百壹十三條規定：
破產財產在優先清償破產費用和***益債務後，依照下列順序清償：
（壹）破產人所欠職工的工資和醫療、傷殘補助、撫恤費用，所欠的應當劃入職工個人賬戶的基本養老保險、基本醫療保險費用，以及法律、行政法規規定應當支付給職工的補償金；
（二）破產人欠繳的除前項規定以外的社會保險費用和破產人所欠稅款；
（三）普通破產債權。
破產財產不足以清償同壹順序的清償要求的，按照比例分配。