廣州市白雲區國家稅務局內設機構為11個，級別為正科級。根據廣州市國家稅務局《關於廣州市國家稅務局系統機構改革後部分機構合署辦公的通知》（穗國稅發〔2010〕71號）精神，我局財務管理科暫不單獨運作，與收入核算科合署辦公；納稅服務科暫不單獨運作，與征收管理科合署辦公；離退休幹部科暫不單獨運作，與人事教育科合署辦公。
1.辦公室
擬訂本單位年度工作計劃、有關工作制度；起草和審核重要文稿；負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、信訪、保密、密碼等工作；承擔稅收宣傳、新聞發布及機關政務公開、政府信息公開工作；承辦網站運行和維護工作；組織稅收科研、學術交流工作；負責印章的管理。
2.政策法規科
組織落實綜合性稅收政策；承擔有關規範性文件合法性審核工作；承辦局外綜合性稅收政策文件會辦工作；承擔重大稅收案件審理工作；辦理行政復議、賠償案件及行政訴訟案件；組織行政處罰聽證；組織實施稅收法律法規、部門規章及規範性文件執行情況的監督檢查，承擔稅收執法質量考核工作；配合財政、審計等部門對稅務部門的監督與審計工作；牽頭組織實施財務管理、基本建設項目、大宗物品采購審計和領導幹部經濟責任審計工作；稅收法律救濟、指導稅收爭議的調解；辦理人大代表議案、建議和政協委員提案的有關事項。
3.稅政科
組織實施增值稅、消費稅、營業稅、企業所得稅、儲蓄存款利息所得稅和法律法規規定的基金（費）等政策的貫徹落實和征收管理工作，擬訂征收管理具體實施辦法；對有關稅種的具體業務問題進行解釋和處理；組織實施綜合性納稅評估和有關稅種的納稅評估、稅源管理、稅基管理、匯算清繳等辦法；負責增值稅防偽稅控系統的推廣和管理；負責增值稅專用發票和其他抵扣憑證的政策及稽核信息管理；指導有關稅種的日常管理、日常檢查；參與有關稅種的納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟工作；承擔有關稅收法律法規和國家（地區）間稅收協議、協定（安排）的具體執行工作；組織實施特別納稅調整工作，解釋和處理具體業務問題。
4.收入核算科
牽頭編制年度稅收計劃、出口退（免）稅計劃（由進出口稅收管理科組織編制該計劃後提供給收入規劃核算科，並分別上報對口上級部門），分配下達年度免抵調庫計劃；監督檢查稅款繳、退庫情況；開展稅收收入分析預測、稅收收入能力估算及重點稅源監控、企業稅收資料調查工作；承擔稅收會計核算、統計核算、稅收票證管理等相關工作；承擔稅收收入數據的綜合管理應用工作。
5.納稅服務科
組織、協調和指導本單位各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織落實納稅人權益保障規章制度及規範性文件；組織協調、實施納稅輔導、咨詢服務等工作，受理納稅人投訴；承擔12366熱線、網站納稅服務欄目、短信系統的運行管理工作。
6.征收管理科
組織落實綜合性稅收征管法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體操作辦法；承辦征管質量考核、風險管理和稅收收入征管因素分析工作；承擔稅務登記、納稅申報、稅控器具推廣應用等方面的相關工作；組織落實個體和集貿市場稅收征管、稅收管理員制度。
7.財務管理科
組織實施會計核算、會計基礎規範工作，分析考核征稅成本；組織實施國庫集中支付工作，辦理具體支付事項；承擔本單位基本建設、資產管理、政府采購的組織牽頭及財務核算工作；著裝管理工作；協助組織實施財務管理、基本建設項目和領導幹部經濟責任審計工作。
8.進出口稅收管理科
組織實施進出口貿易稅收管理工作，擬訂稅收管理具體實施辦法；制定出口退（免）稅計劃；承擔出口貨物退免稅的審核審批、免抵調庫、年終清算工作；組織開展出口退（免）稅評估分析監控工作和專項檢查工作，參與執法檢查工作;組織進出口稅收政策執行情況的日常監督檢查；負責進出口貨物稅收法律法規、政策的宣傳和培訓工作；負責出口貨物稅收函調管理工作；配合有關部門開展反騙稅工作。
9.人事教育科
組織落實幹部人事管理制度；承擔機構編制、幹部任免、人員調配、勞動工資、人事檔案、計劃生育管理、公務員管理、專業技術職務管理等人事工作；按管理權限負責出國（境）人員的審查工作；組織實施績效管理工作；承擔管理權限內領導幹部和後備幹部的管理、考核及監督工作；監督檢查本單位執行幹部人事規章制度情況。組織實施本單位稅務文化建設和基層建設；擬訂並組織實施人員培訓、學歷教育工作規劃、年度計劃，開展培訓質量考核與評估。
10.監察室
組織落實紀律檢查、行政監察工作制度，擬訂具體實施辦法；組織協調本單位的黨風廉政建設和反腐敗工作；受理對本單位工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及有關申訴；查處本單位工作人員違法違紀案件及其他重要案件；配合上級單位做好對領導班子和領導幹部的巡視檢查工作，協助有關部門組織實施領導幹部任期經濟責任審計、財務內部審計等監督檢查工作；開展執法監察和糾風工作。
11.辦稅服務廳
負責納稅人到稅務機關辦理的各種涉稅事項，具體包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款解繳、欠稅公告、發票購銷、稅法宣傳、金稅發售、報稅稽核、咨詢輔導和受理減免申請及有關優惠政策申請等。
機關黨委辦公室 負責單位的黨群、黨建工作；承擔思想政治工作和精神文明建設；指導工會、***青團、婦委會工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作。
離退休幹部科 承擔本單位離退休幹部的服務和管理工作。