“營改增”後，國稅地稅整合資源，深化合作，在減少辦稅成本、提高工作效率等方面取得了初步成效，但實際工作中，還存在壹些問題，制約著國地稅合作工作的深入開展。
（壹）合作的認識不夠深入。隨“營改增”全面推進，地稅局在合作中承擔了更多的工作量，由於承擔了較大的壓力與風險，主觀上有想法有看法；國稅局則認為地稅業務已大量減少，再委托國稅局代征稅款，難免增加國稅工作量，國稅人員思想上不予重視，有所排斥。工作量不平衡導致國地稅心態不壹，依賴政府、依靠上級的思想比較嚴重，工作主動性、積極性不夠、解決問題的辦法不多。
（二）合作的領域還不夠寬。由於國稅、地稅屬兩個不同的獨立執法主體，執法的側重點不同，使用的發票、管轄的稅種也不同，在使用文書及程序等方面，國地稅也存在壹定的差異。致使壹些合作只能停留在表面，無法進行深度合作。如：聯合稽查打擊偷逃稅方面、發票管理等方面還有差距。特別是在稽查工作中，往往會出現國稅剛查完，地稅又來查的情況，檢查不同步，處理不壹致，不僅增加了稅收成本，而且還加重了納稅人的負擔。
（三）信息***享度不高。隨著金稅三期系統全面上線，雙方在系統中已能實現聯合稅務登記、聯合辦稅服務。但由於國稅、地稅前期征管軟件的獨立性和管理體制的差異性，雙方征管數據（財務報表信息、發票信息、稅源信息等）暫時無法有效互通互聯。納稅人信息不能及時***享利用，為後期風險管理工作的開展帶來阻力。
（四）委托代征工作協作機制不完善。目前，國稅與地稅按照方便納稅人和主體稅種征管原則，雙方就“營改增”後的二手房交易增值稅、私房出租增值稅及核對征收個體工商戶個人所得稅、地方稅附加等相互委托代征，但雙方均有各自的工作重點和任務，在實際操作過程中，很可能會出現因征收數據傳遞不及時，出現少征、錯征、漏征，導致稅款流失的情況。
二、強化國稅地稅合作的對策——瞄準“三方***贏”
全面落實國地稅聯合辦稅，既是稅制改革的重要部分，又是提升征管質量的重要步驟，更是維護納稅人合法權益的重要舉措。要以國稅、地稅、納稅人“三方***贏”為目標，著力搞好國地稅聯合辦稅工作，我們認為今後應從以下幾方面加以改進。
（壹）政府主導，實現無縫對接。深入推進國地稅合作，地方政府有期待，基層稅務機關有需求，廣大納稅人有期盼。各級政府要把國地稅聯合辦稅作為壹個重要議題在政府常務會上進行研究，專題部署。稅務機關要充分運用好現有資源，相互借鑒管理經驗，在最大範圍內降低征納成本，提高征管效率。
（二）循序漸進，夯實合作基礎。國稅地稅兩家應在現行稅收法律法規框架內，***同研究壹些有利於稅收工作、堵住漏征漏管、防止稅款流失的措施辦法。如：在聯合開展稅務稽查方面，建立稅務稽查案件長期協作機制，任何壹方對***管納稅戶進行稅務檢查時，應相互通氣，交換稽查信息數據，***同建立涉稅違法信息庫；對已定性為重大涉稅案件的***管企業，雙方應聯合制定檢查計劃，確定***同檢查案源，按規定程序報批後聯合實施稽查，避免重復檢查；對不能實行聯合稽查的案件和接到不屬於自己管轄範圍的舉報案件，要及時向對方傳遞信息，確保稽查成果***享和稅收違法案件得到及時查處。
（三）密切協作，提高代征水平。國稅、地稅應在委托代征方面加強合作，定期向對方提供代征稅款及附征稅費數據信息，***享征收信息，及時解決代征中出現的問題。采取隨機抽查方式了解主稅和附征稅費是否壹壹對應，做到稅費無積壓、無挪用，入庫及時、準確。
（四）綜合治稅，建立長效機制。國稅、地稅應定期召開征管工作聯席會議，及時傳遞相關信息、資料，***同就征管中存在的***性問題進行商討，***同研究解決方案，建立起涵蓋征收、管理、稽查和納稅人權益保護等各環節的長效合作機制，努力實現辦稅過程“1+1=2”、征收成本“1+1<2”、稅收收入“1+1>2”的目標。