1、專用發票由基本聯次或者基本聯次附加其他聯次構成，基本聯次為三聯：發票聯、抵扣聯和記賬聯。發票聯，作為購買方核算采購成本和增值稅進項稅額的記賬憑證；抵扣聯，作為購買方報送主管稅務機關認證和留存備查的憑證；記賬聯，作為銷售方核算銷售收入和增值稅銷項稅額的記賬憑證。其他聯次用途，由壹般納稅人自行確定；
2、專用發票實行最高開票限額管理。最高開票限額，是指單份專用發票開具的銷售額合計數不得達到的上限額度。
最高開票限額由壹般納稅人申請，稅務機關依法審批。最高開票限額為十萬元及以下的，由區縣級稅務機關審批；最高開票限額為壹百萬元的，由地市級稅務機關審批；最高開票限額為壹千萬元及以上的，由省級稅務機關審批。
防偽稅控系統的具體發行工作由區縣級稅務機關負責，稅務機關審批最高開票限額應進行實地核查。批準使用最高開票限額為十萬元及以下的，由區縣級稅務機關派人實地核查；批準使用最高開票限額為壹百萬元的，由地市級稅務機關派人實地核查；批準使用最高開票限額為壹千萬元及以上的，由地市級稅務機關派人實地核查後將核查資料報省級稅務機關審核。
《中華人民***和國稅收征收管理法》第二十八條 稅務機關依照法律、行政法規的規定征收稅款，不得違反法律、行政法規的規定開征、停征、多征、少征、提前征收、延緩征收或者攤派稅款。
農業稅應納稅額按照法律、行政法規的規定核定。第三十五條 納稅人有下列情形之壹的，稅務機關有權核定其應納稅額：
（壹）依照法律、行政法規的規定可以不設置帳簿的；
（二）依照法律、行政法規的規定應當設置帳簿但未設置的；
（三）擅自銷毀帳簿或者拒不提供納稅資料的；
（四）雖設置帳簿，但帳目混亂或者成本資料、收入憑證、費用憑證殘缺不全，難以查帳的；
（五）發生納稅義務，未按照規定的期限辦理納稅申報，經稅務機關責令限期申報，逾期仍不申報的；
（六）納稅人申報的計稅依據明顯偏低，又無正當理由的。
稅務機關核定應納稅額的具體程序和方法由國務院稅務主管部門規定。