各級稅務機關必須高度重視稽查選案工作的重要性，各個部門之間應形成合力，建立科學的選案制度，統籌安排選案工作。要大力提高稅務稽查選案人員的業務水平，培養專業的人力資源。要把提高選案人員的整體素質作為壹項重要工作來抓，盡快培養出壹批業務全面的稅務稽查選案人員，不但要精通財務知識、稅法政策、計算機應用等基礎技能，還要熟悉掌握企業的行業特點、生產經營方式等信息，只有這樣才能滿足稅務稽查選案工作的需要。
（二）整合利用現有信息資源，加快稅務稽查選案的軟件開發
建立集中的"備查信息庫"，改變以往被動選案的工作方法，以計算機系統為平臺，對各類信息資源進行收集、整理、儲存。結合當前數據信息，盡快開發出適合稅務稽查工作需要的"人機結合"方式的選案軟件。初選時，借助計算機系統提高海量數據的加工處理速度，根據人工設置的參數、指標，對信息庫中符合條件的信息進行歸納整理。復選時，通過人工分析提高個案的準確性，抽取部分典型企業，對其涉稅情況進行調研，為稅務檢查的實施提供有效地查案線索。
（三）確定系統完整的稅務稽查選案指標體系
稅務稽查選案評價指標的選擇和確定，是直接關系到選案質量高低的壹項最重要的基礎性工作。要緊緊圍繞企業的經濟活動，對已掌握的數據資料運用各種方法深入揭示可能出現的各種情況，就其經濟效果與各種涉稅事項等諸因素之間的關系，進行橫向和縱向的定量比較，在綜合分析的基礎上提出能夠定性的量化指數標準，從而作為確定納稅異常戶的參照依據。選案人員可以利用各類財務報表中項目間的勾稽關系，進行稽核，檢查其填列的正確性，進而找出涉稅問題的線索。通過設定公允的參數指標形成涉稅指標體系，結合動態信息同步調整形成"數據倉庫"，為以後的評估分析預置信息源。
（四）加強各部門間的工作聯系，增強選案的針對性
整合信息資源，拓寬選案範圍，構架橫向選案體系。以查前分析為核心，實現稅收分析、納稅評估、稅源監控、稅務稽查等各環節的有機銜接。在計劃統計、稅收征管、稅務稽查等部門之間建立信息***享、雙向反饋、統籌協調、良性聯動的運行機制。形成壹張嚴密的工作網絡，以便及時發現納稅異常問題。稅務管理部門將轄區內的重點稅源戶，特殊行業的重點企業，稅負變化異常、長期零稅負和負稅負申報、納稅信用等級低以及在日常管理和稅務檢查中發現問題較多的納稅人，均納入評估的重點關註對象。實施過程中，稅收管理員要通過日常征管工作，及時掌握納稅人實際生產經營情況，參考行業稅負監控數據、各類評估指標預警值等，對企業進行"點對點"納稅評估，並決定有關評估案件是否移送稽查部門。切實形成通過稅收分析及時發現納稅異常情況，通過納稅評估查找原因，並將涉嫌偷逃稅的對象及時移轉稅務稽查，通過稅務稽查落實評估疑點的工作機制，較好地發揮各部門的整體合力。
（五）建立多元化的稅收信息采集網絡
建立起縱橫交錯、內外相連、輻射範圍廣、傳遞速度快、監控能力強的稅收信息網絡。註重加強與國稅部門的配合，拓展選案渠道。
要建立起信息交換和聯席會議制度，互相通報稅務檢查實施情況，分別進行信息篩選、分析加工。
對涉及兩個部門的涉稅案件及時向對方稽查部門通報有關查處情況。要建立國、地稅聯查體系。國、地稅稽查部門聯合行動，不僅節省人力、物力，避免重復檢查、多頭檢查，而且通過"聯手"，能夠提高稽查工作效率和質量。每年由兩局牽頭，國、地稅稽查部門聯合查辦幾起有代表性的大要案件，不僅對涉稅違法行為起到強有力的震懾作用，也可以為建立完善國、地稅聯手的稽查體系提供寶貴的實踐經驗。
（六）註重經驗總結，建立長效學習機制
工作中應註重對精品案件的總結歸納，實現檢查壹個行業，總結壹套規律的工作模式。要不斷剖析前期選案工作的不足，充分掌握區域行業特點，挖掘典型案源，形成行業或區域稽查經驗。同時要建立起長效學習機制，以請進來、走出去的方式吸收外部經驗，以樹典型、搞評比的措施推廣內部優秀經驗。逐步形成以點帶面，全面開花的工作局面。