(二)辦公室:負責局機關行政管理系統建設；負責重要會議的組織和會議決定事項的督辦；負責NPC提案和CPPCC提案的辦理；負責文秘和公文管理、政務信息、新聞發布、保密、檔案、信訪、安全和接待工作；負責局機關辦公自動化；負責本局行政經費和資產的管理；負責本局的計劃生育工作；負責系統的稅務宣傳。
(3)政策法規司:負責地方稅收政策和稅制改革的調查研究，為稅制改革提供建議；制定地方稅務綜合業務的規章制度；負責稅務業務和法律事務的協調；負責監督檢查稅收法律法規的執行情況；辦理稅務行政處罰聽證、行政訴訟和行政復議。
(4)計劃財務部:負責全市地方稅收計劃的編制和任務分配；稅收進度的統計、分析、檢查和通報；負責稅務預決算的編制和管理；負責稅收票證的收集和發放；負責系統固定資產和稅務工作設備的管理；負責地方稅源調查統計、重點稅源監督管理、納稅能力測算和稅種宏觀分析；準備當地稅務會計和統計報表，並提供相關稅務信息。
(5)稅收征管辦公室:負責稅收征管法及其細則的實施；研究制定有關地方稅收征管制度和辦法；負責全市地方稅收征管體制、征管模式和征管運行機制的改革和完善；負責協調解決稅收征管中的問題；負責地方稅務登記、納稅申報、稅務賬簿、憑證等資料的管理；負責征收管理的質量評估；負責個體工商戶和集貿市場的稅收管理；負責全市普通發票的印制、發放和管理。
(6)工商稅務管理處:負責營業稅、城市維護建設稅、教育費附加、資源稅、車船使用稅、車船使用牌照稅、房產稅、城市房產稅、城市土地使用稅、印花稅、土地增值稅等稅收政策的管理、總說明和執行情況的調查；負責稅收政策執行情況的監督檢查；負責涉外稅務管理；處理有關稅收減免的具體事宜。
(7)所得稅管理處:負責地方企業所得稅和個人所得稅政策執行情況的管理、壹般解讀和調查；負責稅收政策執行情況的監督檢查；管理集體企業和私營企業的財務工作；處理有關稅收減免的具體事宜。
(八)基金管理處:負責政府決定的各種基金和社會保障費的征收管理；貫徹執行基金和社會保險費的政策規定並監督檢查執行情況；負責基金和社會保險費征繳的調查研究；下達各項基金和社會保險費的征繳計劃。
(9)監察室:受同級和上級紀檢監察部門雙重領導；負責本系統幹部職工的廉政建設。負責本系統管理的幹部違紀案件的調查處理；處理群眾的投訴和舉報；組織實施對本系統領導機關和稅務人員執行國家法律、法規、政策和決定的監督檢查；負責本系統黨風廉政建設和政治紀律執行情況的調查研究，提出改進意見，監督指導下壹級紀檢監察工作；負責本系統的內部審核。
(10)機關黨委辦公室:負責宣傳貫徹黨的路線方針政策和上級黨組織的決議；負責黨組織的系統管理和黨員幹部的教育，發揮黨組織和黨員的作用；負責市局黨委的日常工作；負責建立本系統標準化黨支部的標準；負責系統工青婦工作；負責建立系統的精神文明；負責基層局(稅務所)創建標準；負責市局目標管理的日常考核和年終考核；負責市局文明(先進)辦公室的創建工作；牽頭組織協調社會公益和機關文體活動；對口負責安排省局、市局黨委、市機關工委；完成領導交辦的其他任務。
(十壹)檢查管理處:負責制定全市地稅系統的稅務檢查制度和方法；負責全市地稅稽查工作計劃的制定、檢查和實施；負責受理、審批、督辦和組織查處市地稅局舉報的重大案件；負責全市地稅系統檢查的管理和評估；負責全市地稅系統稅務檢查證的登記、發放和管理；負責全市地稅系統征管、稽查信息的收集、分析和反饋。
(十二)信息中心:承擔全系統的信息化建設；負責整個系統計算機網絡的建設和管理；負責應用軟件的開發、使用、推廣和培訓；負責收集和處理稅務信息；承辦領導交辦的其他工作。
(十三)服務中心:負責辦公、居住等場所的安全和物業管理；負責機關車輛和食堂的管理和接待；負責機關後勤管理和房產維護；承辦領導交辦的其他工作。
(14)國際稅收研究會秘書處:負責收集涉外信息和資料；承擔稅務研究所下達的稅收研究任務，完成總局研究所和每年“兩會”的重點課題；負責“兩會”常務理事會、理事會、研討會、表彰會的籌備工作；負責與總局、省局、國稅系統、省市民政部門、社會科學界和全市群眾團體的聯系協調；負責組織開展國內外稅收學術交流；負責組織全系統的群眾性稅收調研工作，搞好應用研究；負責《基層稅務研究》雜誌每月的組稿、審稿和編輯工作。