1、發放年終獎的當月工資高於5000元時，年終獎扣稅方式為：年終獎乘以稅率-速算扣除數，稅率是按年終獎除以12作為“應納稅所得額”對應的稅率；
2、當月工資低於5000元時，年終獎個人所得稅等於年終獎減去5000乘以月工資乘以稅率減去速算扣除數，稅率是按年終獎減去5000減去月工資除以12作為“應納稅所得額”對應的稅率。
獎金的作用有哪些
1、合理的獎金分配可以提高職式的工作積極性；
2、獎金是多勞多得的壹種體現，是對工資制度的必要補充；
3、獎金能有效地促進財富的合理分配。
法律依據：《中華人民***和國個人所得稅法》第二條
下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：
（壹）工資、薪金所得；
（二）勞務報酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特許權使用費所得；
（五）經營所得；
（六）利息、股息、紅利所得；
（七）財產租賃所得；
（八）財產轉讓所得；
（九）偶然所得。
居民個人取得前款第壹項至第四項所得（以下稱綜合所得），按納稅年度合並計算個人所得稅；非居民個人取得前款第壹項至第四項所得，按月或者按次分項計算個人所得稅。納稅人取得前款第五項至第九項所得，依照本法規定分別計算個人所得稅。
第三條個人所得稅的稅率：
（壹）綜合所得，適用百分之三至百分之四十五的超額累進稅率（稅率表附後）；
（二）經營所得，適用百分之五至百分之三十五的超額累進稅率（稅率表附後）；
（三）利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十。