2.登錄成功後，點擊網頁頂部的“我要納稅”，進入網頁底部的“申報納稅”或“我的待辦事項”——“增值稅壹般納稅人申報”，未申報事項後點擊“申報”。
3.進入“增值稅壹般納稅人申報”界面，通過填寫《增值稅納稅申報表(扣稅表)附件4》進行增值稅加計扣除申報。
首先，根據企業實際經營情況，如實填寫《增值稅納稅申報表(適用於壹般納稅人)》、《增值稅納稅申報表附壹(本期銷售額明細)》、《增值稅納稅申報表附二(本期進項稅額明細)》。
4.將增值稅納稅申報表附頁二第12欄(本期進項稅額明細)本期申報抵扣的進項稅額和本期轉出的進項稅額合計15%計算後，分別填入增值稅納稅申報表附頁四第6欄第2欄本期。
數據填寫完畢後，系統會自動計算本期可抵扣金額，並根據企業本期應納稅額自動計算本期實際可抵扣金額及期末余額。
5.確認數據無誤後點擊保存，返回“增值稅壹般納稅人申報”主界面，根據企業實際經營情況填寫所需申報表，然後點擊“申報”。
點擊“申報”，系統會自動檢查。如果核對成功，會自動跳轉到補稅申報界面，完成相關申報並進行支付。加扣時申報就結束了。
法律依據:
關於增值稅發票管理等相關事宜的公告
五、增值稅小規模納稅人(其他個人除外)有增值稅應稅行為，需要開具增值稅專用發票的，可以自願使用增值稅發票管理系統自行開具。對選擇自行開具增值稅專用發票的小規模納稅人，稅務機關不再為其開具增值稅專用發票。增值稅小規模納稅人應計算銷售增值稅專用發票應繳納的增值稅金額，並在規定的納稅申報期內向主管稅務機關申報繳納。填寫增值稅納稅申報表時，本期開具的增值稅專用發票銷售額，按照3%和5%的征收率分別填寫在《增值稅納稅申報表(小規模納稅人適用)》第2欄和第5欄“本期數”對應欄目中。