荊州博物館的前身是1951年建立的湖北省文史館荊州工作組、湖北省文物保護管理委員會荊沙分會。當時，由荊州地委、專署委派王幹清同誌（解放初任江陵縣副縣長）壹人主持籌建工作，選擇開元觀作為館址，經費由專署、地委統戰部分別撥給，專署文教局直接開支。
1952年調進兩名工作人員（53年調走），1953年又調進楊元發同誌。由於人員編制少，因此常常采取臨時抽調縣專業人員或聘請社會上具有壹定史學知識的老人，如鐘祥的戴祺生、江陵的張秘之等參與文史資料的鑒別、研究工作，宣傳貫徹國家文物保護政策法令，開展文物調查、保護管理工作。
1954年，王幹清同誌調省後，彭桂全同誌調任主任至1957年，工作人員先後雖充實到七人，但實際上只有少數同誌堅持正常工作，為掌握全區文物分布概況，加強文物保護管理，文教局於1957年配備了專職幹部對文物重點地區進行調查摸底，為推動全區文物普查工作作準備。
1958年，經專署辦公室批準，正式建立湖北省荊州專區博物館，隸屬荊州專區文教局主管。博物館是全地區的文物和博物事業機構，擔負全區的文物調查、勘探、保護、征集和考古發掘工作，舉辦歷史文物及壹些臨時性的陳列展覽，接待國內外觀眾參觀，負責館藏文物的保護和保養，開展考古學和博物館學的研究工作。當時由陳庭吉同誌、黃生貴同誌分別擔任副主任。1960年，李世蓀同誌調博物館任副主任。1961年，經荊州專署批準，將原湖北省人民政府文物保護管理委員會荊沙分會更名為“湖北省荊州專區文物保護管理委員會”，主任委員江洪（行署副專員），辦公室主任潭道山，副主任李世蓀等。此機構雖屬地區文物管理機構，但不另配幹部，具體業務工作仍由博物館負責。
1964年，李世蓀同誌任博物館副館長，1965年人員編制8人，其中行政1人，業務人員7人。
1966年，文化大革命開始，博物館成立了新的革命領導小組，滕壬生同誌擔任組長，全館職工6人，其中業務人員5人。
1969年，博物館更名為“江陵縣展覽館”，隸屬江陵縣管理，陳列展覽內容以農業為主，同時舉辦收租院展覽。
1971年，博物館重新收歸地區管理，恢復荊州地區博物館革命領導小組，高道成同誌調入博物館擔任黨支部書記。
1973年4月，經地區文化局批準，將原“博物館革命領導小組” 名稱改為“湖北省荊州地區博物館”，當時，全館編制為16人，內部機構有行政組（3人）、業務組（11人）、後勤組（2人）。
1974年8月，滕壬生同誌擔任博物館黨支部副書記。1975年9月，張緒球同誌被任命為博物館副館長，另又增加劉振芳同誌為副書記（1976年4月調走）。
1976年至1977年，領導班子由黨支部書記高道成、副書記張鵬、滕壬生、副館長王堯、張緒球同誌組成。內部機構有文物組、保管組、接待組、後勤組。76年人員編制為37人，77年增至40人，其中黨員有20人。 1978年，張鵬同誌擔任博物館館長，增加副館長李世蓀、丁設科同誌。彭浩、陳躍鈞同誌為文物組負責人，劉立力為保管組負責人，另有接待組、後勤組等機構。全館人員編制為42人，其中黨員18人。
1979年，黨支部書記高道成、副館長王堯同誌調走，人員編制為51人。
1980年，張鵬館長調往地區科委。6月，劉先杜同誌調博物館擔任黨支部副書記和館長，滕壬生同誌任副書記、副館長，張緒球、李世蓀、丁設科繼續擔任副館長。內部機構有文物組（組長陳躍鈞、副組長彭浩）、接待組（組長範典昭）、保管組（組長黃曼華）、後勤組（組長鄭中山）、辦公室（劉立力）。全館***有黨員20人。此外，博物館館址在開元觀對面西側（現為市婦幼保健院）興修擴建並正式對外開放。
1981年，館領導班子成員未變，人員編制發展為63人（其中固定職工53人）。
1982年，劉先杜同誌被任命為黨支部書記。
1983年5月，鄭中山同誌被任命為副館長。1984年，副館長李世蓀同誌離休。4月，黨支部書記劉先杜調往荊州地區賓館。博物館領導班子進行了相應的調整，經地區宣傳部批準：滕壬生同誌任黨支部書記，張緒球同誌任館長，丁設科、鄭中山、彭浩同誌任副館長。內部機構有辦公室（主任黃曼華）、文物考古部（主任陳躍鈞）、文物保管部（主任代聲平、副主任吳順清）、陳列美工部（主任栗紅約、副主任朱由）、群眾工作部（主任範典昭、副主任郭傳玉）、革命文物部（副主任段紀明，後來調走此機構撤消）、總務科（科長胡昌玉）、保衛科（副科長謝永滿）。同年六月，經地區工會批準，博物館工會正式成立，工會主席丁設科。全館人員編制為56人，其中黨員15人。
1985年，領導班子成員未變。博物館館址則由開元觀西側（現婦幼保健院）重新遷至開元觀東側，新陳列大樓對外試展。
1986年5月，增加副館長陳躍鈞同誌。6月，經省公安廳批準，我館建立了民警室。6月11日，新建博物館陳列大樓、珍寶館舉行開館典禮，正式對外展出。全館人員發展為63人。
1987年至1990年，領導班子成員未變，仍由滕壬生（黨支部書記）、張緒球（館長）、丁設科、鄭中山、彭浩、陳躍鈞（副館長）組成。
1987年，博物館人員為71人，內部機構新增設了文保部。
1988年，經地區編委批準，內部機構為辦公室、考古部、群工部、保管部、文保部、總務科、保衛科，人員編制為72人。1989年人員增加到83人，其中副研究館員4人，館員24人。
1990年，內部機構增加了革命文物部，郭傳玉同誌任主任。全館人員增至90人。新修珍寶館正式對外開放。
1991年，王從禮同誌任副館長。丁設科同誌享受副縣級待遇。余元枝同誌任辦公室副主任，鮑仁偉同誌任外展部副主任，李紅同誌任群工部副主任。
1992年，經地區編委批準，增設“對外展覽部、旅遊服務部、文物復制工藝部、財務科”四個內部機構。副館長、工會主席丁設科同誌因病逝世。全館幹部職工91人。
1993年，何努同誌任考古部主任，陳官濤任辦公室主任。全館幹部職工增至96人。
1994年12月，荊沙合並，博物館更名為“荊沙市荊州博物館”。國家文物局、公安部批準我館為文物系統博物館壹級風險單位。四月，市旅遊局批準我館為旅遊涉外定點單位。同年，胡昌玉同誌任我館黨支部副書記。全館幹部職工增至101人。
1995年，省文化廳同意我館設立湖北省文物總店荊沙市分店。12月，市委組織部批準陳元高同誌任博物館黨支部書記、張緒球任博物館館長、滕壬生任名譽館長。彭浩、陳躍鈞、胡昌玉、鄭中山、王從禮任副館長。院文清任陳列部主任。全館幹部職工102人。1996年，王從禮同誌任工會主席。我館進行了內部機構改革和調整，任命何努任考古部主任、劉德銀、陳官濤任副主任，柯光榮任保衛科科長，代聲平任保管部主任，龔英明任陳列部主任，李紅任群工部主任、侯純珍任副主任，周先素任財務科科長，郭傳玉任總務科科長、謝永滿、楊乾松任副科長，史基礎任服務公司經理、朱江松任副經理、余元枝任楚樂宮主任，張群英任辦公室副主任，史玉芬任省文物商店荊沙市分店經理、金陵任副經理。
1997年，我館更名為“湖北省荊州市博物館”。全館幹部職工97人。
1998年10月，黨支部書記陳元高同誌調離我館。全館進行機構改革，張萬高任考古部主任、劉德銀、陳官濤任副主任，陳華亮任保管部主任，龔英明任陳列部主任，李紅任群工部主任，張群英任辦公室主任，余元枝任楚樂宮主任，肖璇任票務科科長、廖平任副科長，翟玉莘任總務科科長、楊乾松任副科長，史基礎任服務公司經理。全館幹部職工93人。
1999年4月，經市編委批準，成立荊州市文物考古勘探大隊，掛靠博物館，實行壹套班子，兩塊牌子。進壹步實行機構改革，我館內設機構12個，即辦公室、總務科、財務科、保衛科、考古部、文物保管部、陳列部、群工部、旅遊服務部、流散文物工作部、楚樂宮、票務科。全館幹部職工94人。 2000年7月，範誌謙同誌調任我館黨支部副書記，王明欽同誌任副館長，鄭中山同誌任工會主席，陳躍鈞同誌任主任科員。全館幹部職工95人。
2001年，實行機構改革和調整，撤消票務科，合並為財務科，朱茵任財務科科長，肖璇任群工部主任，翟玉莘任保管部主任，陳華亮任保衛科科長，楊開勇任辦公室主任，張萬高、劉德銀任考古部副主任。全館幹部職工94人。
2002年5月，我館進壹步實行機構改革和調整，***設10個部門，即文保中心（吳順清任主任）、考古所（劉德銀、張萬高任副所長）、保管部（翟玉莘任主任），陳列部（龔英明任主任），群工部（肖璇任主任），辦公室（余元枝任主任），保衛科（陳華亮任科長），財務科（朱茵任科長），楚樂宮（程潔任主任）總務科（楊乾松任科長）。12月，經市委宣傳部批準，張萬高、劉德銀同誌任博物館副館長，胡昌玉同誌任主任科員，工會主席鄭中山同誌離職退養。全館幹部職工91人。
2003年4月，內部機構進行調整，楚樂宮和並入群工部，程潔任主任，肖璇任保管部主任，賈漢清任考古所所長。7月，領導班子進行了調整，原館長張緒球同誌延退，任命為名譽館長，劉娟同誌調任博物館黨支部書記，王明欽同誌任館長，範誌謙（兼任黨支部副書記、工會主席）、張萬高、劉德銀任副館長、彭浩同誌任主任科員。
2004年4月，陳列部改名為陳列外展部，群工部改名為宣教部，李紅任宣教部主任，楚樂宮重新獨立出來，鮑仁偉任楚樂宮主任。彭昊任總務科科長，丁鍵任辦公室主任。
2005年，荊州博物館第壹屆學術委員會成立，張萬高任主任委員；中***荊州市委編委辦公室批復設立荊州博物館熊家冢考古工作站；李亮任荊州博物館團支部副書記。
2006年1月，荊州博物館對各部門幹部進行調整：龔英明任陳列外展部主任；李紅任宣教部主任；彭昊任行政科科長；楊開勇任文物考古研究所副所長；朱江松任文物勘探大隊副隊長；範誌謙任荊州博物館主任科員，不再擔任博物館副館長、黨支部副書記職務；荊州市委編委辦公室同意在荊州市博物館熊家冢考古工作站加掛荊州市熊家冢管理處牌子；張緒球退休，不再擔任荊州博物館名譽館長職務。
2007年5月，成立信息技術部,金陵任主任。
2008年，荊州博物館被國家文物局評為國家壹級博物館並實行免費開放，為加強安全保衛工作，成立了安全應急領導小組和行動小分隊。
2009年劉德銀任荊州博物館黨支部副書記；賈漢清、彭昊均當選為荊州博物館副館長。
2010年，荊州博物館對中層幹部進行調整：楊開勇任文物考古研究所所長，趙曉斌任文物考古研究所副所長；劉瑋任財務科科長，鄭梅任財務科副科長；雷中翠任辦公室副主任；毛芳任宣教部副主任；程潔任陳列部副主任；劉露任保管部副主任；肖玉軍任信息部副主任；黃成家任保衛科副科長；趙寧武任後勤科副科長。同年，荊州博物館工會第五屆委員會成立，由趙自剛、劉雁、羅軍、李亮、翟玉莘、李曉紅等六位組成，趙自剛任工會主席，羅軍任工會審查委員，李曉紅任女職工委員。
2011年，中***市委編委辦公室批準荊州博物館加掛荊州市簡牘研究所牌子, 楊開勇任所長，趙曉斌任副所長。