增值稅實行鏈條抵扣機制，以納稅人當期銷項稅額抵扣進項稅額後的余額為應納稅額。其中，銷項稅額是指按照銷售額和適用稅率計算的增值稅額；進項稅額是指購進原材料等所負擔的增值稅額。當進項稅額大於銷項稅額時，未抵扣完的進項稅額會形成留抵稅額。
留抵退稅辦理的流程如下：
1、企業辦理出口退稅時，在申報單上選擇留抵退稅，並按照規定填寫相關信息，例如留抵退稅的金額、稅種等；
2、海關審核和批準出口退稅後，將退稅款項留存在海關備抵，同時向企業出具留抵退稅證明書；
3、企業在境內進口貨物時，可以向海關申請使用留抵退稅款項抵扣進口環節增值稅、消費稅等稅款。企業需要提交留抵退稅證明書和進口貨物的相關文件，海關審核後決定是否批準使用留抵退稅款項抵扣稅款。
外貿公司出口退稅註意事項：
1、必須是壹般納稅人；
2、進項發票需要開在出口日期之前；
3、進項發票、出口發票、報關單、商品名稱、單價、數量必須要壹致；
4、保留全部的商品付款單據、海運付款單據、運輸單據、離岸證明、到岸證明等等；
5、到稅局辦理出口退稅資格認定；
6、申請出口退稅數據必須在次年的四月底之前提交完畢。
綜上所述，留抵退稅只適用於企業在出口商品時享受退稅政策，並且只針對增值稅的退稅。此外，留抵退稅的操作需要符合國家稅務部門的相關規定，否則將可能導致企業被罰款、被追繳稅款或者被列入不良信用記錄等不良後果。
法律依據：
《關稅和貿易總協定》第六條
壹締約國領土的產品輸出到另壹締約國領上，不得因其免納相同產品在原產國或輸出國用於消費時所須完納的稅捐或因這種稅捐已經退稅，即對它征收反傾銷稅或反補貼稅。
第十六條
免征某項出口商品的關稅，免征相同商品供內銷時必需繳納的國內稅，不能視為壹種補貼。