(1)內部機構
1，辦公室
負責文電、機要、會議、宣傳、檔案、財務等機關日常運行；承辦安全、保密、信訪和政務公開工作；負責系統設備、固定資產和代理後勤服務的管理。
2.政策和法規科
負責稅收政策研究和法制教育；承擔本機關相關規範性文件的合法性審核；承辦稅務行政復議、行政訴訟和行政賠償。
3.勞動和財產行為稅部分
負責組織實施營業稅、資源稅、財產行為稅和涉外地方稅征管，制定具體征管辦法；解釋和處理具體的業務問題。
4.所得稅科
負責組織實施企業所得稅和個人所得稅的征收管理，制定具體的征收管理辦法；解釋和處理具體的業務問題。
5.基金(費用)科
負責組織實施社會保險費、文化事業建設費、水利建設基金、地方教育附加和其他基金(費)的征收管理，制定具體征收管理辦法；解釋和處理具體的業務問題。
6.收入規劃和會計科
負責編制稅(費)收入中長期規劃、年度稅(費)收入計劃；監督檢查稅(費)的繳納和退還；承擔稅收(費)收入的分析預測和重點稅源的監控管理；負責稅(費)統計、稅(費)數據和稅(費)票管理。
7.納稅服務科
承擔納稅服務體系建設的相關工作；制定納稅服務的具體工作規範和操作流程；指導和協調納稅(支付)咨詢服務、納稅(支付)爭議調解、稅收法律救濟等工作，受理納稅人(支付)投訴；承擔地方稅收信用體系建設的相關工作；承擔為大中型企業提供納稅服務的工作。
8.行政和科技發展科
制定稅收管理的具體措施和辦法並組織實施；承擔地方稅收征管改革的組織實施工作；管理稅務發票；承擔稅務管理信息化建設中業務需求整合和流程優化的綜合管理。
9.政治部
承擔機構設置、人員管理、團隊建設和教育培訓工作；按照幹部管理權限，承擔市縣地方稅務局領導班子和相當級別幹部管理相關工作；負責離退休人員的服務管理。
10，財務管理科
負責系統資金和財務管理；編制財務預算和決算；負責系統基建管理。
11，內部審計科檢查員
監督檢查稅收法律、法規、規章和規範性文件的執行情況；承擔系統財務、基建、大宗貨物采購審計和領導幹部經濟責任審計。
機關黨委負責機關和直屬(派出)單位的黨群工作。
紀檢監察機構按照有關規定設置。