南京師大地理科學學院的歷史可追溯到1919年的南京高等師範學校，當時南高師改國文部為文史地部，增設地理學科。1920年南京高等師範學校擴建為東南大學，1921年建地學系，竺可楨為創辦人，任系主任。1928年東南大學經第四中山大學、江蘇大學改為國立中央大學，1930年地學系分為地理系和地質系，胡煥庸任地理系主任。 1943年李旭旦接任系主任。1949年4月，南京解放後，中央大學改名為南京大學，李旭旦仍擔任地理系主任直至1952年院系調整中，李旭旦偕金祖孟等同誌來南京師範大學（時稱南京師範學院）創辦地理系。在治學思想上秉承前中大地理系和金陵女大地理系勤奮、務實、開拓、創新的學風，開始了南師大地理科學學院的創業歷程。
1952年南師大（時稱南京師範學院）開始招收壹年制專修班和二年制專修科。1953年春江蘇師範學院地理科並入。1956年建地理系，招收地理本科，同時招收兩年制專科，***計8屆兩年制專科。1958年在校學生達 381人，為當時全院學生人數最多的系科之壹。1963年起停止招生，在校學生逐年減少，1966屆學生畢業後，地理系已沒有學生，但建制和師資設備均未變動。1969年江蘇教院地理科並入。1973年恢復招生，***招4屆工農兵學員，學制3年，曾壹度副修歷史。1977年恢復高考後，地理專業招收四年制本科。1989年增設旅遊管理專業，招收三年制的專科生，1995 年招收本科生。1993年地理系增設土地管理專業，招收兩年制專科生，1999年招收本科生。 1999年創辦GIS本科專業並招生。
1980年區域地理專業招收碩士研究生，1981年地圖與遙感專業招收碩士研究生，1986 年自然地理專業和第四紀地質等專業先後招收碩士研究生，1987年地理教學論招收碩士研究生.1994年自然地理專業招收博士研究生，1998年招收地圖與GIS專業博士研究生，2000年建立地理學博士後流動站並接受進站研究人員，2001年地理學所屬三個二級專業全面招收博士研究生。2002年地圖與GIS專業，被批準為國家級重點學科。2003年新增“環境地理學”、“海洋地理學”和“第四紀地質學”3個博士點，“環境地理學”、“海洋地理學”和“旅遊管理”3個碩士點。 2002年汪永進教授在美國Science期刊上發表論文1篇、入選全國優秀百篇博士學位論文並獲得國家傑出青年科學基金。2002年沙潤等5位教授獲國家優秀教學成果二等獎1項，林振山教授、張鷹教授等人分別獲得中國高校自然科學獎二等獎和國家海洋局創新成果獎二等獎。2003年王橋教授獲得國家自然科學二等獎、閭國年教授等人獲得新疆維吾爾自治區科技進步二等獎。2004年林振山教授負責的“環境演變與種群演化的研究”獲教育部提名國家科學技術獎自然科學壹等獎、王建教授主持的《現代自然地理學》和湯國安教授支持的《地理信息系統》兩個課程都榮獲國家精品課程稱號。
2004年虛擬地理環境實驗室入選江蘇省國家重點實驗室培育點。2006年17000平方米嶄新的“地理科學樓”將坐落在南京美麗的仙林校區，該樓將設有5000平方米的虛擬地理環境開放實驗室、3500平方米的環境演變與生態建設開放實驗室、1500平方米的人文地理與旅遊綜合開放實驗室、3000平方米的教學實驗室和3000平方米的圖書資料室。
2014年學院的目標是朝著建設國內壹流、研究型地理學科教學、科研和人才培養基地邁進。新起點、新氣象、兼容並蓄、團結拼搏，全院教職員工願為我國地理科學這座雄偉的科學宮殿添磚加瓦。 白世彪 蔡祖聰 曹 敏 曹芳東 查 勇 陳 霞 陳 曄 陳仕濤 陳鎖忠 儲少瑩 崔 靜 戴金霞 戴科偉 鄧 歡 丁正山 董 平 董福田 杜明霞 方 斌 葛軍蓮 龔建新 管衛華 郭 飛 韓睿明 郝麗莎 賀德剛 侯國林 胡 斌 胡 迪 黃昌春 黃克龍 黃麗娟 黃新琦 黃震方 賈國正 江 南 江亭桂 蔣建軍 金 燕 金昌偉 靳 誠 孔興功 李 楊 李安波 李發源 李紅波 李吉均 李劍波 李時銀 李 碩 李玉鳳 李雲梅 林 潔 林冰仙 林振山 劉 惠 劉 健 劉 嬪 劉 晴 劉 榮 劉殿兵 劉國飛 劉紅玉 劉會玉 劉金娥 劉樹鳳 劉曉艷 劉學軍 龍 毅 陸玉麒 閭國年 呂 恒 羅明慧 彭 元 齊相貞 錢 誼 喬偉峰 邱 群 任 娜 商誌遠 申衛收 沈 婕 沈陳華 沈冠軍 沈永明 盛業華 盛重義 舒 強 宋誌堯 蘇 錦 孫 劍 孫壹鳴 孫毅中 孫在宏 湯國安 湯茂林 陶卓民 萬 露 汪 閩 汪 濤 汪永進 王 紅 王 建 王 靜 王 平 王冬梅 王風賀 王國祥 王俊淑 王美珍 王亞華 王延華 王永君 王宇飛 王在峰 韋玉春 魏 巍 魏正貴 溫 騰 溫永寧 吳 江 吳長彬 吳江瀅 吳明光 吳啟焰 夏忠歡 蕭家儀 謝 標 謝澤林 徐 旳 徐 敏 徐良將 徐淑琴 徐曉明 嚴 蜜 楊 浩 楊 林 楊 柳 楊 山 楊 昕 楊 燕 楊勝利 楊文燕 姚亦鋒 葉 超 葉 春 俞肇元 袁林旺 張 郴 張 東 張 宏 張 卡 張 莉 張 鷹 張 勇 張 嶂 張 卓 張金波 張茂恒 張明禮 張書亮 張顯球 張小林 張雪英 張益民 章婷曦 趙 侃 趙 林 趙 媛 趙誌軍 鄭洪波 鐘文輝 周 衛 周安寧 周潔雨 周進明 周良辰 周年興 朱 嶺 朱 玲 朱長青 朱國偉