生產企業出口退稅申報系統的操作流程包括以下步驟：
1.企業備案和登錄：企業在系統進行備案，獲取登錄賬號和密碼，備案信息包括企業名稱、稅號、出口業務信息等。備案完成後，企業可以使用賬號和密碼登錄系統。
2.數據錄入：企業需要錄入出口業務相關的數據，包括出口貨物信息、銷售額、購進額等。這些數據可以從財務系統或出口業務系統中導入，也可以手動錄入。
3.數據審核：系統會對錄入的數據進行自動審核，包括數據完整性、準確性、邏輯關系等。如果數據審核不通過，系統會提示錯誤信息，企業需要修改數據後重新審核。
4.退稅申報：數據審核通過後，企業可以生成退稅申報表，並提交到稅務部門。稅務部門會對申報表進行審核，如果審核通過，會將退稅款項發放給企業。
在使用出口退稅申報系統時，企業需要保證錄入數據的準確性和完整性，避免出現錯誤和遺漏。同時，企業需要及時了解稅務部門的政策和要求，確保申報過程符合相關規定。通過合理使用出口退稅申報系統，企業可以提高申報效率，降低成本，為企業的發展提供有力支持。