1．經濟技術開發區分局（科級建制）
負責區內地方稅源納稅申報，稅款和有關基金（費）征收以及催報催繳和逾期稅款收繳與處理工作；負責稅收計劃、稅收會計、稅收統計以及收入分析等；負責稅務登記、認定管理、核定申報方式和發票管理；負責行政處罰審理決定及執行工作，負責執行稅收保全和強制執行措施等。
經濟技術開發區分局內設綜合科、管理壹科、管理二科、管理三科、基金（費）征集辦公室5個科室。
2．居巢區地方稅務局（科級建制）
負責編報、分配區內地方稅收收入計劃、組織各項地方稅收收入；負責區內地方稅的征收管理和稽查工作，指導區內地方稅收業務；負責社會保險費、水利建設基金、文化事業建設費等基金（費）的征收管理；監督檢查區內國家稅收法律、法規和規章的貫徹執行；負責稅務行政復議、訴訟和組織稅收宣傳等工作。
居巢區地稅局設黨組，機關股室6個，下設10個分局。