勞動法中的員工和用人單位中的員工待遇差別很大，有法律保護嗎？

不會的，事業單位的編制確認的是與單位的人事關系，而不是勞動關系，所以編制的待遇不是勞動法規定的。但按照《事業單位編制人員管理條例》進行管理，所以《勞動法》對編制人員和用人單位的待遇差別有很大的法律保護。聘任制適用勞動法的相關法律規定，而適用於公務員的相關法律規定則是正式編制。