對於農村魚塘的確認，有關各方應先進行協商。協商不成的，由縣級以上人民政府協調。當事人對人民政府作出的決定不服的，可以依法向人民法院提起行政訴訟。
法律客觀性:
《中華人民共和國土地管理法》第十二條依照有關不動產登記的法律、行政法規進行登記。依法登記的土地所有權和使用權受法律保護，任何單位和個人不得侵犯。《中華人民共和國民法典》第二百壹十七條為不動產權屬證書，證明權利人享有不動產物權。房地產權屬證書記載的事項應當與房地產登記簿壹致；記載不壹致的，除非有證據證明不動產登記簿確有錯誤，否則以不動產登記簿為準。