雖然我國計算機審計在信息化的推動下發展很快，但仍處於學習和探索階段，還存在很多問題，主要表現在以下幾個方面。
1，相關法律法規不完善，標準缺乏可操作性。
2.計算機信息系統的可審計性不強。
3.審計軟件的實用性和通用性不強。
4.信息系統審計尚未被業界接受。
二、提高計算機審計技術發展的對策
1，加強計算機審計立法。
計算機審計立法是保證計算機審計正常發展的關鍵措施。
2.制定計算機審計標準。
審計準則是審計工作應遵循的規範和標準，是評價審計工作質量的權威規則。
3、大力推廣計算機輔助審計技術，提高計算機審計水平。
計算機輔助審計技術主要指審計軟件和數據測試技術。面對日益先進和復雜的審計環境和對象，傳統的審計方法已經不能滿足現代審計的要求。在這種情況下，審計人員創新審計方法，大力推廣計算機輔助審計，充分利用計算機、網絡等現代信息技術，無疑是壹條很好的途徑。
4.加快計算機審計人才的培養。
與傳統審計相比，計算機審計在審計線索、審計內容、審計風險等方面都發生了變化，這就要求審計人員學習新的理論知識，掌握信息技術條件下的審計方法。因此，從長遠來看，培養大量能夠獨立開展計算機審計業務的專業人才是解決我國計算機審計人才短缺的有效途徑。