水資源保護和水汙染防治的職責分工，市水務局負責水資源保護，市環保局負責水環境質量和水汙染防治。兩部門要進壹步加強協調配合，建立磋商機制，定期通報水資源保護和水汙染防治的相關情況，協商解決相關重大問題。
市環保局發布水環境信息，並對信息的準確性和及時性負責。市水務局應當與市環保局協商，發布水資源信息中涉及水環境質量的內容。
按照交通部門的職責分工，在河道及其河口與航道重疊範圍內發生的違反水法律法規行為，由市水務局依法處理，涉及主要航道的違反水法律法規行為，由市水務局會同市交通委或廣州港務局處理。
其他部門在建設涉及水務的交通設施時，應事先征求市水務局的意見。市水務局在建設涉及港口、航道、水路運輸的水上設施時，應事先征求市交委或廣州港務局的意見。
下屬機構的設立、職責和編制另行規定。
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