農村土地被占用，權利人可以通過以下方式維權:1。與直接侵權人交涉，要求停止侵權行為；2.找當地村委會和派出所調解；3、收集侵權證據，然後去法院起訴，要求停止侵權，排除障礙。當事人協商不成的，應當向人民政府國土資源行政主管部門申請調解。國土資源行政主管部門應當在雙方平等自願的基礎上進行調解。調解時要做到:1，查明事實，明辨是非，分清責任；2.依據法律法規和政策耐心勸說，講清利益關系；3.必須符合法律法規，有原則性，有靈活性；4、爭取相關部門的合作與支持。當事人在國土資源行政主管部門主持下自願達成的協議，應當經國土資源行政主管部門審核同意，並由雙方蓋章。調解書壹經送達當事人，即發生法律效力，成為雙方履行法律的依據。當事人不願調解或者拒絕接受調解，或者調解成立後在調解協議送達前反悔的，可以直接請求人民政府依法處理。
法律依據
《中華人民共和國土地管理法》第十六條由當事人協商解決。協商不成的，由人民政府處理。單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間或者個人與單位之間的爭議，由鄉級或者縣級以上人民政府處理。當事人對有關人民政府的決定不服的，可以自收到決定通知之日起30日內向人民法院提起訴訟。在土地所有權和使用權爭議解決之前，任何壹方不得改變土地使用現狀。