兩者的區別在於，委托合同是甲方證明乙方有權代替甲方行使甲方部分權利的法律合同..合作合同是雙方利益、權利和責任的證明性合同。委托合同，又稱“委托合同”。是指受托人以委托人的名義和費用為委托人辦理委托事務，委托人按照約定支付報酬的合同。合作合同是指雙方或多方在不設立另壹法人的情況下，為開展投資活動而簽訂的文件。雙方約定只能在法律允許的範圍內，不能約定屬於禁止投資的領域或行業；不能約定名為合作企業的合同實際上是借款合同；不能同意偷稅漏稅；不能同意違反外匯管理規定，否則簽訂的合同內容可能違法無效。合資、合作合同是特殊合同，通常涉及雙方重大經濟利益，必須經政府主管部門依法批準後才能生效。委托合同具有授權性質，合作合同是平等的。
法律客觀性:
根據《中華人民共和國民法通則》第七百八十八條規定，建設工程合同是承包人進行工程建設，發包人支付價款的合同。建設工程合同包括工程勘察、設計和施工合同。