2003年，宣漢縣撤銷了唐駿、雙河、新化、樊噲、鳳城、南壩、清溪、天生8個工委，以及楊烈、農心、清平、黃龍、平樓、龍關、東升、三勝、嶽西、胡成、雞鳴、自由、河壩、梨、方鬥、三橋。將原來的20鎮53鄉調整為20鎮35鄉。
2004年2月底前完成鄉鎮區劃調整，2004年3月底前撤銷區工委，2004年5月底前調整合並約268個村委會。2004年，宣漢縣轄20個鎮。2005年4月20日，經四川省人民政府批準，同意宣漢縣撤銷昆池鎮，昆池鎮行政區域並入南壩鎮，南壩鎮政府設在南壩聖墩東路。2005年9月28日，經四川省人民政府批準，同意將宣漢縣龍泉等4個鄉建設為土家族鄉。2005年4月20日，昆池鄉原行政區域並入南壩鎮。截至2005年底，宣漢縣轄19個鎮和4個民族鄉。2012年2月，宣漢縣土主鄉經四川省人民政府批準。截至2012，宣漢縣轄19個鎮，30個鄉，4個民族鄉。
鎮區:東鄉、唐駿、清溪、普光、天生、白樹、八角、南壩、五寶、鳳城、黃圖、華景、樊噲、新華、黃金、胡加鎮、毛壩、雙河、大城。
鄉鎮:嶽明鄉、紅嶺鄉、柳池鄉、三河鄉、老君鄉、黃石鄉、七裏鄉、廟安鄉、天寶鄉、林東鄉、下壩鄉、涼風鄉、夏商鄉、塔河鄉、岔河鄉、天臺鄉、關山鄉、南坪鄉、林峰鄉、桃花鄉、白馬鄉、貝奇鄉。
民族鄉:三墩土家族鄉、舒淇土家族鄉、龍泉土家族鄉、渡口土家族鄉。