可以異地辦理港澳臺通行證。大陸居民可在全國公安機關任壹出入境管理部門申請換(換)發普通護照、港澳通行證、臺灣通行證。辦理時需要攜帶身份證原件、港澳通行證照片、居住證。港澳通行證是中華人民共和國和公安部出入境管理局簽發的旅行證件。供內地居民因私往來香港或澳門使用，適用於旅遊、探親、商務、培訓、就業、留學等非公務活動。
異地辦理港澳臺通行證的程序:
1.帶上本人身份證原件；
2.提供港澳通行證照片；
3.準備居住證；
4.向當地出入境管理部門提出申請。
綜上所述，大陸居民可在全國公安機關任壹出入境管理部門辦理港澳臺通行證。
法律依據:
中華人民共和國出境入境管理法
第十條
中國公民往來內地與香港特別行政區、澳門特別行政區，以及中國公民往來內地與臺灣省，應當依法申請通行證，並遵守本法的有關規定。具體管理辦法由國務院制定。