對於有抵押的房子，只要房貸已經還清，就可以辦理新的房產證。
但有幾種情況，不動產登記機構是不會查詢的。根據《不動產登記資料查詢暫行辦法》第十壹條的規定，不予查詢的，應當出具不予查詢通知書:
(壹)查詢人提交的申請材料不符合本辦法規定的；
(二)申請查詢的主題或者查詢事項不符合本辦法規定的；
(三)申請查詢的目的不符合法律法規規定的；
(四)法律、行政法規規定的其他情形。查詢人對不動產登記機構出具的不予查詢通知書不服的，可以依法申請行政復議或者提起行政訴訟。
擴展數據
房屋產權仍由產權人本人管理，債權人只是按期取息，並無房屋管理權。貸款還清後，產權人將終止房契抵押。
債務人不履行債務時，債權人有權依法處分抵押的房屋，並有權就處分抵押的房屋所得價款優先受償。
正規的抵押，無論是在商業銀行還是住房公積金，都必須去房產局辦理抵押登記和換領他項權證，否則不能貸款。所以有沒有抵押都是在房產局記錄或者備案的。
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