如果對電子考勤記錄的表面真實性進行審查，發現有明顯的造假行為(比如連續幾天的考勤記錄完全壹致，會議記錄完全壹致)，不符合常理，那麽未經員工本人簽字認可的電子考勤記錄，不予受理。如果電子考勤從表面上看是合理的，那就要和其他證據壹起考慮，通過比較來判斷。經審查，電子考勤記錄與其他證據能夠相互印證的，應當予以采信。此時，即使員工以未經其簽名確認為由否認電子考勤記錄的真實性，也不予受理。
只有員工本人未簽字的電子考勤記錄，無其他相應證據支持。如果電子考勤記錄沒有造假或有嫌疑的痕跡，且與其他證據沒有沖突，則不應輕易否定證據的有效性，而應視為企業完成了對員工考勤的初步舉證責任。員工否認電子考勤記錄的，由員工負相反的舉證責任，反駁證據的真實性。
員工否認企業提交的電子考勤記錄真實性，但難以完成相反舉證的，可以申請對電子考勤記錄原始數據進行鑒定，通過司法鑒定確認企業提交的電子考勤記錄是否被篡改。鑒定後發現電子考勤原始數據確實被篡改的，應當認定為企業偽造證據，承擔敗訴後果，認定其違法解除勞動合同應當賠償，並承擔相應的司法鑒定費用作為處分的標誌。如果發現電子考勤原始數據未被篡改，則視為企業對員工考勤違規完成舉證責任，解除勞動合同符合法律規定，員工承擔相應的司法鑒定費用作為處分的標誌。
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