根據規劃，提高農村環境保護水平包括四個方面:壹是保障農村飲水安全。開展農村飲用水水源調查評價，推動劃定農村飲用水水源保護區或保護區。加強飲用水源環境綜合整治。建立健全農村飲用水水源地環境監管體系，加強執法檢查。開展環境保護宣傳教育，提高農村居民的水源保護意識。在有條件的地區推進城鄉供水壹體化。二是提高農村生活汙水和垃圾處理水平。鼓勵城鎮和規模較大的村莊建設汙水集中處理設施，將城市周邊城鎮和村莊的汙水納入城市汙水收集管網進行統壹處理。居住分散的村莊應當推進分散、低成本、易維護的汙水處理設施建設。加強農村生活垃圾收運處置設施建設，統籌城市、縣城周邊鄉鎮無害化處理設施和收運體系建設；在交通不便的地區，探索就地處理模式，引導農村生活垃圾實現源頭分類、就地減量和資源化利用。三是提高農村種植業和養殖業的汙染防治水平。引導農民使用生物農藥或高效低毒低殘留農藥，農藥包裝要進行無害化處理。大力推廣測土配方施肥。推動生態農業和有機農業發展。加強廢棄農膜、稭稈等農業生產廢棄物的資源化利用。開展養殖汙染調查，減少太湖、巢湖、洪澤湖養殖面積和投餌數量。四是改善重點地區農村環境質量。落實農村環境綜合整治目標責任制，實施農村清潔工程，開發推廣適用的綜合整治模式和技術，重點解決環境汙染問題突出的村莊和集鎮。到2015年，完成6萬個建制村環境綜合整治任務。