集美大學在職研究生開設的專業以非全日制研究生為主，需要參加全國統考，經過初試和復試後才能入學。在職研究生學費按學校規定收取。集美大學農業碩士學費8000元/生/年。教育碩士和體育碩士10000元/年；稅務碩士、社會工作碩士、機械碩士、生物醫學碩士、交通運輸碩士11000元/年；會計碩士15000元/年；文科碩士45000元/生。考生可以根據自己的實際情況進行選擇。
非全日制研究生報考條件為:國家承認的大學畢業，高職高專畢業兩年及以上達到本科畢業生同等學力水平，獲得碩士或博士學位。管理類專業也會要求考生有壹定年限的工作經驗。
在職人員也可以選擇在同等學力的申碩學習。同等學力的申碩免試入學。壹般大專以上學歷的學生都可以報名學習，完成學業後可以獲得結業證書。符合條件的同學可以參加申碩考試，申請碩士。熱門專業有法學、工商管理、社會學等在職研究生。同等學力的申碩學費相對較低，壹般專業在2-4萬元之間。申碩每年5月參加全國聯考，3月在中國學位與研究生教育信息網進行網上報名。考生必須在規定時間內分別通過外語和專業課，達到及格線。
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