1.如果有外債，長期不註銷可能導致法人和股東的個人責任，也可能有罰款；公司不註銷可能會影響法定代表人以後對其他公司的投資。
2.民辦非企業單位申請註銷後，在相應時間內不得開展清算、註銷以外的活動。
第二，分析
民辦非企業單位的註銷流程:
民辦非企業單位申請註銷登記，報業務主管單位審批，向登記管理機關領取註銷登記表；在業務主管單位和有關機關的指導下，成立清算組織，組織清算工作，撰寫清算報告；清算結束後15日內向登記機關申請登記；登記主管機關應當自收到前款規定的全部材料之日起30日內，作出批準或者不批準註銷的決定。準予註銷登記的，發給註銷證明。民辦非企業單位的註銷登記，由登記管理機關予以公告，公告費由民辦非企業單位按照《民辦非企業單位登記暫行辦法》的規定承擔，由登記管理機關代收代繳。
三、民辦非企業單位註銷登記的條件是什麽？
民辦非企業單位有下列情形之壹的，必須申請註銷登記:
1.章程規定的解散事由出現；
2、不再具備註冊條件的；
3、目的發生根本變化；
4.因其他變更，與原登記機關管轄不壹致的；
5.因分離而溶解；
6.因合並而解散；
7.原業務主管單位不再擔任業務主管單位，90天內找不到新的業務主管單位；
8、有關行政機關依照法律法規規定認為需要註銷的；
9、其他原因需要解散的。