1.主要職責是:起草醫療保險、生育保險、醫療救助等醫療保險制度的法律法規、政策、規劃和標準，制定部門規章並組織實施。組織制定和實施醫療保險基金監督管理辦法，建立健全醫療保險基金安全防控機制，推進醫療保險基金支付方式改革。組織制定醫療保障籌資和待遇政策，完善動態調整和區域調劑平衡機制，統籌城鄉醫療保障待遇標準，建立健全與籌資水平相適應的待遇調整機制。組織制定和實施長期護理保險制度改革方案。
2.組織制定城鄉統壹的藥品、醫用耗材、醫療服務項目和醫療服務設施的醫保目錄和支付標準，建立動態調整機制，制定醫保目錄準入談判規則並組織實施。組織制定藥品和醫用耗材價格、醫療服務項目和醫療服務設施收費等政策，建立合理確定和動態調整醫保支付醫療服務價格的機制，推動建立市場主導的社會醫療服務價格形成機制，建立價格信息監測和信息發布制度。
3.制定藥品和醫用耗材招標采購政策並監督實施，指導藥品和醫用耗材招標采購平臺建設。制定定點醫療機構協議和支付管理辦法並組織實施，建立健全醫療保險信用評價體系和信息披露制度，監督管理醫療服務行為和納入醫療保險的醫療費用，依法查處醫療保險領域違法違規行為。負責醫療保障管理、公共服務體系和信息化建設。組織制定和完善異地就醫管理和費用結算政策。建立健全醫療保障關系轉移接續制度。開展醫療保障領域的國際合作與交流。完成黨中央、國務院交辦的其他任務。