3.雖然面積擴大了，但上海自貿區的核心任務，包括投資貿易便利化、產業開放、金融創新等。，只能在120平方公裏的有限區域內先行先試。
4.擴區後的上海自貿區試點期為2-3年。隨著三年後上海、天津、廣東和福建自貿區經驗在全國範圍內的復制和推廣，以及隨後外商投資相關法律的修訂，中美BIT的簽署，乃至中國加入TPP，自貿區大規模的制度創新和開創性工作將告壹段落，自貿區管轄的政府職能最終將回歸到正常的功能區管理和服務職能。
5.國家壹直嚴格控制新設立的機構和公務員編制。
6.壹年多來，上海自貿區管理協調中遇到的體制機制問題，急需通過比較大的結構性改進來解決。這些突出問題包括條塊分割的縱向協調耗時低效、政策碎片化程度嚴重、定期會議的橫向協調周期長、反應慢，不能滿足自貿區不斷變化的實際需求、“企業能進不能出”現象背後的信息及時溝通和民眾預期管理等，亟待加強。
7.隨著自貿區擴大到4個，預計中央政府層面的自貿區協調機制將得到完善，新的協調機制將被引入，甚至新的協調機構將出現，這也將對地方政府層面的對接機制提出現實要求。
新成立的天津、廣東、福建自貿區跨區域特征更加明顯，也會遇到縱向協調和橫向跨區域組織協調的問題。具有先發優勢的上海應充分利用此次擴圍的契機，大膽對管理協調機構和機制進行重大調整，順應自貿區發展的實際需要，做好與中央新的協調機制或機構對接的準備，同時為國內其他自貿區的管理制度建設提供好的經驗。