權利的產生是不同的。船舶優先權是根據法律的規定產生的，屬於法定擔保物權；船舶抵押權基於當事人簽訂的船舶抵押合同，屬於協議擔保物權。
有擔保的債權是不同的。船舶優先權保障特殊的法定海事請求，如船員工資、人身傷亡、港口費、救助報酬和侵權行為造成的財產損失等。船舶抵押擔保了借款債務。
效果就不壹樣了。船舶抵押權的效力來源於登記；然而，船舶優先權的效力既不需要占有，也不需要登記。賠償的順序不壹樣。根據我國《海商法》第二十五條規定，船舶優先權先於船舶優先權受償，船舶抵押權先於船舶優先權受償。
船舶優先權是根據法律的明文規定產生的，即不是由當事人在合同中自行產生的，而是由法律賦予的權利產生的。
船舶抵押:
船舶抵押權是指船舶抵押權人在抵押人不履行債務時，依法拍賣抵押人提供作為債務擔保的船舶，並從船舶拍賣價款中優先受償的權利。船舶抵押貸款是壹種廣泛使用的船舶融資方式。債務人不履行債務時，可以采取法律措施，從船舶變價中優先受償。
船舶抵押權的標的是船舶，包括舊船和建造中的船舶。建造中的船舶不是嚴格意義上的船舶，因為它不完全具備船舶的功能。盡管如此，包括中國在內的許多國家的海商法都規定，建造中的船舶也可以設定船舶抵押權。這種規定對船舶建造的融資很有幫助。
有權設定船舶抵押權的是船舶所有人、船舶所有人授權的人或者船舶所有人。船舶所有人授權的人通常是船舶所有人的代理人，可以船舶所有人的名義設定船舶抵押權。船舶所有人是指對同壹艘船舶享有所有權的幾個人。