在試點註冊制下，上海證券交易所負責科創企業發行上市審核，中國證監會對股票發行進行註冊。
發行人申請首次公開發行和科技創新板上市，應當按照中國證監會的有關規定準備註冊申請文件，由保薦機構保薦，並向上海證券交易所報告。上海證券交易所收到註冊申請文件後，應當在5個工作日內作出是否受理的決定。
上交所主要通過向發行人提問、發行人回答問題的方式進行審核工作。基於科技創新板的定位，判斷發行人是否符合發行條件、上市條件和信息披露要求。上海證券交易所按照規定的條件和程序，對發行人股票公開發行並上市作出是否同意的審核意見。發行人股票獲準公開發行上市的，應當向中國證監會提交審核意見、發行人註冊申請文件及相關審核材料，履行發行註冊手續。發行人股票未獲準公開發行上市的，作出終止發行上市審核的決定。
中國證監會收到上海證券交易所提交的審核意見、發行人註冊申請文件及相關審核材料後，辦理發行註冊手續。發行註冊主要關註上海證券交易所發行上市審核內容是否存在遺漏，審核程序是否符合規定，發行人在發行條件、信息披露要求等主要方面是否符合相關規定。中國證監會認為有需要進壹步說明或者落實的事項，可以要求交易所進壹步查詢。中國證監會應當在20個工作日內對發行人的註冊申請作出是否核準的決定。
科創板實施註冊制改革堅持市場化方向，堅持以信息披露為中心的監管理念，強化發行人和中介機構的責任，努力通過配套機制的安排維護市場穩定。
具體來說，差異主要包括以下幾個方面:
壹是上市條件和審核標準更加優化，更加開放。
二是實行以信息披露為中心的發行審核制度。
三是實行市場化承銷機制。
四是強化中介機構責任。
五是完善配套措施。
法律依據:
中華人民共和國證券法
第九條公開發行證券必須符合法律、行政法規規定的條件，並依法報國務院證券監督管理機構或者國務院授權的部門登記。未經依法登記，任何單位和個人不得公開發行證券。證券發行註冊制的具體範圍和實施步驟由國務院規定。
有下列情形之壹的，為公開發行股票:
(壹)向不特定對象發行證券；
(二)向特定對象發行證券超過200人，但不計入依法實施員工持股計劃的員工人數；
(三)法律、行政法規規定的其他發行行為。
非公開發行證券不得以廣告、公開勸導或者變相宣傳的方式進行。
第二十壹條國務院證券監督管理機構或者國務院授權的部門依法對證券發行申請進行登記。證券公開發行和登記的具體辦法由國務院規定。
根據國務院規定，證券交易所可以對公開發行證券的申請進行審核，判斷發行人是否符合發行條件和信息披露要求，督促發行人完善信息披露內容。
依照前兩款規定參與證券發行申請登記的人員，不得與發行申請人有利害關系，不得直接或者間接接受發行申請人的饋贈，不得持有發行申請登記的證券，不得與發行申請人私下接觸。