企業對被列入經營異常名錄有異議的，可以自公示之日起30日內向作出決定的工商行政管理部門提交書面申請和相關證明材料。此外，企業對其被列入經營異常名錄的決定可以申請行政復議或者提起行政訴訟。
起訴過程如下:
1.壹方當事人提起訴訟，應當先提交起訴書，並按照對方當事人的人數提交相應的副本。當事人是公民的，應當寫明雙方的姓名、性別、年齡、籍貫、住址；當事人是單位的，應當寫明單位的名稱、地址、法定代表人或者負責人。起訴書正文應當寫明請求、起訴的事實和理由，尾部應當簽名或者加蓋公章。
2.根據誰主張誰舉證的原則，原告向法院起訴時應提交以下材料:
(1)原告主體資格的材料。如居民身份證、戶口簿、護照、港澳同胞回鄉證、結婚證等證據的原件及復印件；企業為原告的，應當提交營業執照副本、工商登記證等材料；
(2)證明原告訴訟請求的證據。如合同、協議、債權文書(借條、借條等。)、收發憑證、信函等。
3.當事人向法庭提交書證時，應當填寫證據清單壹式兩份，寫明提交證據的名稱和頁數。證據經法庭承辦人核對後，由承辦人在證據清單上簽名蓋章，壹份交當事人，壹份存檔；
4.立案庭應當在當事人履行必要程序並提交相關證據材料後七日內，對符合立案條件的，辦理立案手續；不符合立案條件的，依法裁定不予受理；
5.當事人應當在收到受理通知書之日起七日內預交案件受理費和其他訴訟費用。如有困難，可在預交期內向我院提出減、緩、免的書面申請。如果他們逾期不繳納或書面申請緩繳、緩繳、免繳未獲批準，仍不提前繳納，我院將裁定自動撤訴。
6.立案後法院會安排案件的審理，當事人要服從法院的工作安排，結案後在財務室結算訴訟費用，做到多退少補。
《中華人民共和國民事訴訟法》第二條* * *中華人民共和國民事訴訟法的任務是保障當事人行使訴訟權利，保證人民法院查明事實，分清是非，正確適用法律，及時審理民事案件，確認民事權利義務關系，制裁民事違法行為，保護當事人的合法權益， 教育公民自覺遵守法律，維護社會經濟秩序，保障社會主義建設的順利進行。
第六條民事案件的審判權由人民法院行使。
人民法院依照法律規定獨立審理民事案件，不受行政機關、社會團體和個人的幹涉。
第十六條民族自治地方的人民代表大會可以根據憲法和本法的原則，結合當地民族的具體情況，制定變通的或者補充的規定。自治區的規定須報NPC常務委員會批準。自治州、自治縣的規定，報省或者自治區的人民代表大會常務委員會批準，並報NPC常務委員會備案。