從中國出航的中國商船，或者返航的中國商船，也會在冬天東北風吹來的時候，經過屯門出海，向南航行到中南半島和南洋群島，再到印度和波斯灣。屯門的對外交通可以追溯到劉宋時期，其目的地是膠州的海港。東晉末年乃至劉宋時期，有個和尚叫北渡禪師。遊歷海內外後，南下香港屯門卓溪，在屯門等船出海，再也沒有返回中土。
在唐力統治時期，有許多商船停泊在屯門，他們被視為危險的地方，所以設立了屯門鎮。隨著衛兵和捕快的駐紮，龔偉屯毗鄰大海。唐玄宗天寶三年(公元744年)，浙江永嘉、明太祖吳靈光作亂，被太守劉巨麟和河南殷的聯軍所滅。當時屯門的地位越來越重要，路過的遊客與日俱增。著名詩人韓愈的《送別十八會》和劉禹錫的《踏浪之歌》也描寫了屯門的情況。由此可見，屯門的交通情況是眾所周知的。
五代時，南漢劉將北渡山命名為瑞應山，並在山北麓建軍寨，設靜海巡察，了解屯鎮，招募流民，收集奇貨。可見其對屯門的特別重視。
北宋初年，屯門仍有屯門碼頭。元朝僅在屯門設置了屯門巡檢司，巡檢員1人，士兵150人，官署在屯村。早在新石器時代，屯門青山灣壹帶已有人居住。
到了漢代，屯門已經有了與制鹽有關的商業活動。
唐代設立屯鎮，隸屬安南都城，由邊防軍駐守，故名“屯”，意為“屯兵之門”。
五代南漢時，巡行靜海，在山麓上建軍營。
在宋朝，設立了壹個巡邏部門來逮捕海盜。
明朝建碼頭，造房屋，分別駐軍。明朝鄭德九年(1514)，葡萄牙人占領了屯門，當時是東關縣，並在那裏安營紮寨。鄭德十六年(1521)，廣東海道副使王泰在海戰中擊敗葡萄牙人，收復屯門。
清代設置了屯村和碼頭。清末改為新安縣。