(1)就業機會不平等。從中國的現狀來看，農民工的就業機會受到了太多的限制，剝奪了他們平等的就業機會。主要表現在三個方面:壹是直接控制行政總量，限制農民工進城就業。大部分農民工只能進入“二級勞動力市場”從事城市勞動力不願意從事的臟、累、差的工作。二是農民工進城就業的不公平收費。農民工要交計生證，失業證等。當他們離開農村時，他們必須支付城市暫住證和健康證明的費用。這些費用無疑提高了農民工的就業門檻。第三，對城鎮居民就業和再就業的特殊優惠政策和措施，造成了對競爭環境的行政幹預和事實上的就業不平等。
(二)勞動關系不規範。目前，壹些用人單位仍不與勞動者簽訂書面勞動合同，或者內容不規範、不平等、不合理。原因是農民工流動性大。新生代農民工對工作環境、生活質量、職業發展有更高的追求，很難長期在壹個崗位上工作。勞動合同對他們來說只是壹種形式。第二，缺乏基本的法律意識。壹些農民工不知道如何通過法律途徑保護自己的合法權益。很多人根本不知道建立勞動關系需要書面勞動合同。壹些農民工雖然與用人單位簽訂了勞動合同，但他們對勞動合同的內容是否平等合理沒有基本的判斷能力。有的甚至與用人單位簽訂了“生死合同”，違反了法律。
(3)工資福利難以保障。主要體現在過分壓低工資，同工不同酬。壹是很多企業規避法律規定，將國家規定的最低工資標準作為農民工的工資標準。二是農民工從事與城鎮居民相同的工作，但工資明顯低於城鎮職工，同工不同酬現象較為普遍。三是設置苛刻條件，如餐飲、建築等行業實行全月標準，曠工壹天扣壹天工資；壹些半生產半生產的企業和單位實行計件工資，給農民工的生活帶來很大的不確定性。四是拖欠農民工工資。以建築行業為例，有的工地每個月只發相應的生活費，工資壹起結算到工程結束或者年底。包工頭攜款跑路，辛辛苦苦壹年也拿不到工資，讓很多農民工選擇了過激的方式討要工資。
(4)工作環境不達標。許多雇主無視法律，不提供勞動保護設施，這威脅到農民工的生命安全和健康。第壹，勞動安全沒有保障。壹些非公企業使用的原材料中含有危險化學品，大大增加了事故傷害和職業危害的發生率。二是工作環境和工作條件惡劣。為了降低成本，大部分非公企業不給農民工配備勞保用品。國家統計局壹項關於農民工生活質量的專項調查顯示，超過壹半的農民工反映他們工作中的安全保護措施不夠嚴格。三是對女性農民工的特殊保護政策沒有落實。
(5)社會保障不到位。由於社會保障體系不完善，社會保險在用人單位的經辦率相對較低，部分農民工工傷或患職業病後得不到有效救濟，無醫、無老問題尤為突出。造成這壹問題的原因是:壹是農民工流動性大，就業形勢不穩定；二是用人單位往往以農民工不好參保，不願意參保為由，逃避法律責任。據統計，2011年，全國只有6837萬農民工參加工傷保險，僅占農民工總數的27%。
(6)缺乏維權組織。農民工在維護自身權益、平衡勞動關系方面的組織化程度還很低。全國人大常委會執法檢查組關於檢查工會法實施情況的報告指出:“由於宣傳工作不到位、農民工流動性大等多種原因，壹些農民工對工會法和工會的作用不了解，壹些基層工會作用發揮不夠，凝聚力不強，入黨積極性不高。目前，中國只有不到三分之壹的農民工加入工會。”農民工沒有自己的工會組織，“決定了農民工階層在面對市場(企業)或國家代理人(政府)時是脆弱的”，“組織化程度低消解了凝聚個體農民工微弱聲音的可能性，削弱了他們的整體話語能力。"
法律依據:
中華人民共和國社會保險法
第九十五條農村居民進城務工，應當依照本法規定參加社會保險。
第九十六條征收農村集體土地，應當足額安排被征地農民的社會保險費，按照國務院的規定，將被征地農民納入相應的社會保險體系。