專業學位研究生教育培養的是高級技術和管理人才，要有壹定的理論，要做壹流的實幹家和高級復合型人才。課程設計以“職業能力”為基礎，而不是掌握某壹門學科的知識體系。“模塊化”制度非常有利於培養這樣的研究生。模塊化課程體系是指將壹個專業應該開設的課程按照壹定的分類方法分成若幹個相對獨立的模塊，所有模塊按照壹定的形式組合成壹個體系。“模塊化”課程體系的優勢在於:①有利於多學科課程的綜合。壹個模塊可以由幾個學科的內容組成，模塊之間相對獨立，橫向聯系，將不同學科之間沒有直接聯系的課程進行整合，形成特定職業所需的知識體系，實現知識、技能、素質的全面培養。②體現課程的靈活性。可以根據實際需要增減模塊，不斷引入壹科壹學的最新技術成果和先進經驗，引入最優秀的技能，使課程體系的變化相對靈活。英國著名科學家伯納德曾說過:“科學是壹種積累的知識傳統。”換句話說，科學創新是知識長期積累的結果。學位承擔著科學創新的責任，課程內容是根據學科的內在邏輯設置的。本科生、碩士生和博士生之間的課程結構體現了層次性、銜接性和遞進性，形成了以縱向深化為主體的知識結構。對於本學科的理論基礎課，呈現梯形結構，即本科生在梯形的最底層，基礎課最寬最粗，博士生在階梯的最頂端，基礎課逐漸減少，深度逐漸增加；至於本學科的專業知識課程，是壹個倒梯形的結構，博士生在梯形的底部，本學科的專業知識是最豐厚的，是在中間的碩士生和碩士生的基礎上進壹步拓寬和深化，是在本科生的基礎上進壹步拓寬和深化。學位研究生教育通過基礎知識和專業知識的縱向積累和深化，拓展研究生的科研思維，提升研究生的科研能力。
專業學位研究生的課程設置應滿足專業需求，並表現出多元性和綜合性的特點。首先，課程很多。專業學位研究生的培養以講座和課堂培訓為主，科研為輔，課程數量往往多於學位研究生。比如美國哥倫比亞大學教育碩士要求至少60學分，而教育文理碩士只要求30學分；中國的MBA課程數量也比壹般的管理碩士多。其次，課程註重科學教育和人文教育的結合。C. W. Case等人認為:“壹個專業首先具有為他人服務的利他特征。”專業相對於普通職業的成熟性和先進性在於專業人員比普通專業人員具有更高的自律性、現實的職業道德和無私的職業精神，這是社會對專業標準的要求，也是專業人員為社會提供服務的本質。專業的這壹特點要求專業學位要註重科學教育與人文教育的結合。科學教育重在“教人做事”，要求研究生掌握人文科學和自然科學的知識、技術和能力；人文教育更註重“做人”這壹倫理文化的基本原則，註重人的道德品質、高尚情操和奉獻精神的培養。專業標準的特點要求專業學位課程既要註重科學教育，又要註重職業道德和個性發展的人文教育。