(1)藥品生產經營許可制度
根據《藥品管理法》規定，開辦藥品生產企業，必須經企業所在地的省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門批準，發給《藥品生產許可證》，並憑《藥品生產許可證》向工商行政管理部門登記註冊。無藥品生產許可證，不得生產藥品。
根據《藥品管理法》規定，開辦藥品批發企業，必須經企業所在地的省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門批準，並發給《藥品經營許可證》；開辦藥品零售企業，必須經企業所在地縣級以上地方藥品監督管理部門批準，發給《藥品經營許可證》，並憑《藥品經營許可證》到工商行政管理部門辦理登記。無藥品經營許可證，不得經營藥品。
(2)良好生產規範(GMP)體系和GMP制度。
藥品生產企業必須按照國務院藥品監督管理部門制定的《藥品生產質量管理規範》組織生產。藥品監督管理部門應當按照規定對藥品生產企業是否符合藥品生產質量管理規範的要求進行認證；通過認證的人員將獲得認證證書。
藥品經營企業必須按照國務院藥品監督管理部門制定的《藥品經營質量管理規範》從事經營活動。藥品監督管理部門應當按照規定對藥品生產企業是否符合藥品生產質量管理規範的要求進行認證；通過認證的人員將獲得認證證書。
(3)藥品註冊制度
根據新的《藥品註冊管理辦法》，藥品必須經過註冊才能生產和銷售。藥品註冊申請包括五種類型:新藥申請、仿制藥申請、進口藥品申請、補充申請和再註冊申請。生產新藥或者有國家標準的藥品，必須經國務院藥品監督管理部門批準，並發給藥品批準文號。藥品生產企業取得藥品批準文號後，方可生產該藥品。
新的《藥品註冊管理辦法》大大提高了新藥註冊審批的科學性和透明度，明確規定“改變劑型、給藥途徑、增加新適應癥的不再批準為新藥”，明確創新藥擁有快速申請審批權，新藥含金量將大大提高。
(4)國家藥品標準體系
國家藥品標準是指國家為保證藥品質量而制定的質量指標、檢驗方法、生產工藝等技術要求，包括《中華人民共和國藥典》、《藥品註冊標準》和SFDA頒布的其他藥品標準。國務院藥品監督管理部門組織藥典委員會，負責國家藥品標準的制定和修訂。
(5)藥品價格體系
列入國家基本醫療保險藥品目錄的藥品和國家基本醫療保險藥品目錄外具有壟斷性生產經營的藥品，實行政府定價或政府指導價；其他藥品實行市場調節價。藥品生產企業、經營企業和醫療機構必須執行政府定價和政府指導價，不得以任何形式擅自提價。
(6)處方藥和非處方藥分類管理制度
中國實行處方藥和非處方藥分類管理制度。通過加強處方藥和非處方藥的監督管理，規範藥品生產經營，引導公眾科學合理用藥，減少藥物濫用和藥物不良反應的發生，保障公眾用藥安全。
(7)中醫藥保護制度
中藥產業是我國的傳統優勢產業，也是未來醫藥生產領域的重要發展方向。國家積極支持民族醫藥產業的發展。在制定壹系列促進醫藥產業健康發展的相關政策的基礎上，還頒布實施了《中藥品種保護條例》和《中華人民共和國中醫藥條例》，促進中藥科研生產持續健康發展。
(8)生物制品批簽發制度
根據《生物制品批簽發管理辦法》的規定，生物制品批簽發是指對疫苗制品、血液制品、用於血源篩查的體外生物診斷試劑以及國家美國食品藥品監督管理局規定的其他生物制品，在每批產品上市或者進口時進行強制檢驗和審核的制度。檢驗不合格或者檢驗不合格的，不得上市或者進口。
(9)血液制品管理制度
血液制品業務必須符合《血液制品管理條例》、《單采血漿站質量管理規範》、《單采血漿站基本標準》和《采供血機構設置規劃指導原則》。
(10)麻醉藥品和精神藥品管理系統
經營麻醉藥品和精神藥品應當遵守《麻醉藥品和精神藥品管理條例》、《麻醉藥品和精神藥品管理辦法(試行)》等相關法律法規。
(11)醫療器械管理系統
中國對醫療器械的生產實行生產許可證和產品註冊制度。我國頒布的醫療器械行業主要法律法規有《醫療器械監督管理條例》(國務院令第276號)、《醫療器械生產監督管理辦法》(國家醫療器械管理局令第12號)、《醫療器械註冊管理辦法》(國家醫療器械管理局令第16號)。此外，醫療器械產品進入國際市場，既要適用進口國醫療器械管理的法律法規，也要通過相關醫療器械監督管理機構的認證，如ISO: 13485認證、美國FDA註冊、歐盟ce認證、日本SG認證等。
(12)醫藥行業環保標準趨嚴。
2008年8月1日，國家環保總局制定的《醫藥工業水汙染物排放標準》(以下簡稱《標準》)正式實施。
該標準要求制藥企業將汙水處理到壹定程度後才能排入自然水體和汙水處理廠，這就迫使制藥企業購買汙水處理設備，建設沈澱池、曝氣池等相關工程。同時，他們應該更加註意減少和控制整個生產過程中的汙染源。所以藥企會在這上面花很多錢，作為前期設施的投入。此外，標準規定現有企業自2010年7月1日起執行新建企業水汙染物排放限值。也就是說，隨著環保的推進，後期汙染物達標成本遠高於前期，意味著後期藥企新增汙水處理成本將直線上升。因此，標準的實施會讓藥企付出很大的成本，未來藥企的治汙成本會逐漸成為產品成本競爭的重要組成部分。