壹、補充協議與主合同發生沖突時，以哪個為準？
壹般情況下以補充協議為準，但也有例外。比如合同生效和修改需審批但補充協議未獲批準的，以主合同為準，招標合同和補充協議構成對主合同的實質性變更而未備案。
相信在了解了居間合同的補充協議與主合同的關系後，對補充協議的制定和履行有了更深的理解。居間合同的補充協議作為主合同的壹部分，起著重要的補充作用。在簽訂補充協議時，建議慎重考慮相應條款，對主合同中未詳細說明的事項進行完善。如果涉及法律術語，可以聯系專業人士。
二、補充協議的內容限制
補充協議的內容具有很大的靈活性，可以通過這種方式隨時變更合同。合同簽訂後是否需要簽訂補充協議，由雙方根據合同履行的實際情況決定。但是，補充協議的內容也必須是有限的。
(1)壹般情況下，補充協議不能涉及主合同約定的主要標的物，不能對主合同進行實質性修改。如果要對主合同進行實質性修改，前提是必須符合法律規定。比如合同履行過程中的正常變更或建築面積變更，可以通過簽訂補充協議或簽證的方式進行。例如，在建設工程施工合同中，如果發包人要將與之相關的次要工程分包給承包人，而承包人又願意承接，雙方可以就增加的工程內容簽訂補充協議。
(2)補充協議不改變主合同的大部分條款。如果補充了太多的新協議或者對主合同進行了太多的修改，就很難稱補充協議為補充協議。補充協議的內容非常廣泛，可以是補充付款、補充驗收程序、補充設計變更。在建設工程的施工和設計合同中，使用補充協議的機會較多，主要是因為在施工過程中或設計開始後，發包人會有很多新的問題需要承包人幫助完成，工程也經常會發生變化。此時，只要雙方同意變更，履行法定變更程序即可。
(3)補充協議不得違反法律、行政法規的強制性規定。補充協議的內容由當事人自由約定，但合同當事人不能利用補充協議鉆法律的空子，規避法律的程序性和實體性規定。比如在建設工程招標中，有的投標單位中標後與招標人簽訂補充協議，將正式的中標合同交給政府部門備案。雙方私下簽訂補充協議，擅自變更合同標的物或價格，雙方按補充協議執行。中標前，投標人與招標人事先約定，按程序中標後，投標人向招標人降低壹定的價格，這是中標的條件。這樣形成的中標及補充協議違反了法律規定，屬於無效協議。有些合同當事人利用補充協議損害國際利益或第三方利益，這種補充協議也是無效的。比如合同中把較小的壹部分工程發包給承包人，結果雙方在補充協議中簽訂較大的工程合同，屬於規避《建設工程招標投標法》的規定。較大的項目不能簽訂補充協議，而應按招投標程序辦理。壹般來說，補充協議的內容屬於主合同中遺漏的內容或附在主合同上的小項目。
3.主合同無效後補充協議是否有效？
要看具體情況。主合同無效後補充協議內容能夠獨立履行的，補充協議有效；補充協議的內容不能獨立履行的，效力待定。合同無效，不影響合同中關於爭議解決方式的獨立條款的效力。為了妳更好的維權。
法律客觀性:
《中華人民共和國民法通則》第五百零九條當事人應當按照約定全面履行義務。當事人應當遵循誠實信用原則，根據合同的性質、目的和交易習慣，履行通知、協助和保密義務。合同履行過程中，當事人應當避免浪費資源、汙染環境和破壞生態。《中華人民共和國民法典》第五百壹十條* *合同生效後，當事人對質量、價款或者報酬、履行地點等沒有約定或者約定不明確的。，他們可以補充協議；不能達成補充協議的，按照合同的有關規定或者交易習慣確定。