總則:作出行政行為的行政機關是被告。具體確認情況如下:
1.行政復議案件中被告的確定
2.委托管理的被告證實。
受行政機關委托的公共服務組織實施行政行為的，受委托的行政機關是被告。
(1)受委托行政機關對受委托組織依法行使委托職權承擔監督責任。
(2)行政訴訟法規定的“授權”只有法律、法規和規章授權，規章以下規範性文件的“授權”視為委托。
註意
委托與授權的區別:委托是委托機關與受委托組織協議的結果，委托機關是行政機關。實際上，委托機關與受委托組織之間存在公法代理關系，不會產生新的行政主體。授權是指立法機關將行政職權賦予行政機關以外的社會組織，賦予其壹定的行政主體資格，實際上是公共事務的壹種分權形式。
3.經上級機關批準作出行政行為的被告予以確認。
當事人對上級行政機關批準的行政行為不服，向人民法院提起訴訟的，對外簽署發生法律效力的文件的機關為被告。
4.被告對行政機關行政行為的確認。
關於代理機構的被告資格，以是否有法律、法規、規章授權為標準。法律、法規、規章授權代理的，代理人取得行政主體和訴訟主體資格，無論其所作的行政行為是否超越授權範圍，都是法律後果的承擔者，都應當是被告。如果法律、法規、規章沒有授權該機關，無論該機關是否以自己的名義行事，在法律上都不是承擔該行政行為後果的法律主體和個人，該機關不能是被告，其所屬的行政機關應當是被告。
5.幾個行政機關與作出同壹行政行為的被告確認。
兩個以上行政機關實施同壹行政行為的，實施該行政行為的行政機關是被告。
註(1)必須是同壹行政行為，即必須是行政決定，文號，內容相同。
(2)所謂“* * *與”應從本質上理解，即參與全部或部分行政行為的意思形成過程，對行政行為的作出產生了重大影響。
6.內部組織的被告證實
這類機構能否成為被告，要看是否得到法律法規和規章的授權。法律、法規、規章授權內設機構，可以合法地以自己的名義作出行政行為，取得行政主體資格的，應當以本機關為被告進行訴訟；沒有法律、法規、規章的授權，內設機構沒有獨立承擔法律責任的能力，應當由設立或者設立的行政機關負責，即被告應當是設立或者設立的行政機關。
7.確認作為本案被告的不作為
不作為案件中被告的確認有兩個標準:
(1)形式標準，即公民是否提出申請，哪個行政機關收到了申請。根據形式標準，公民提出申請時，行政機關不實施任何法律行為的，收到申請的行政機關為被告。公民向行政機關提出申請，收到申請的行政機關認為不屬於本機關職權範圍的，應當書面告知正確的行政機關或者將申請材料轉送有管轄權的行政機關。在這種情況下，主管行政機關是被告。
(2)實體標準，即受理申請的行政機關是否有作為的義務。只有承擔被告職責的行政機關才能成為被告。通常的做法是以實體標準為主，形式標準為輔。
8.開發區管理機構及其職能部門的被告資格
當事人對國務院和省級人民政府批準的開發區管理機構作出的行政行為不服的，開發區管理機構是被告；對國務院和省級人民政府批準的開發區管理機構的職能部門作出的行政行為提起訴訟的，其職能部門為被告；對其他開發區管理機構的職能部門作出的行政行為提起訴訟的，開發區管理機構是被告；開發區的行政機構沒有行政主體資格的，設立該機構的地方人民政府為被告。
9.村委會和居委會的被告資格
當事人對村民委員會、居民委員會依據法律、法規和規章的授權履行行政管理職責的行為不服的，村民委員會、居民委員會為被告。當事人對行政機關委托的村民委員會、居民委員會的行為不服的，受委托的行政機關是被告。
10.機構和行業協會的被告資格
當事人對高等學校等事業單位和律師協會、註冊會計師協會等行業協會根據法律、法規、規章授權實施的行政行為不服的，以該事業單位和行業協會為被告。當事人對高等學校等機構和律師協會、註冊會計師協會等行業協會接受行政機關委托的行為不服的，受委托的行政機關是被告。
11.房屋征收部門的被告資格
市、縣級人民政府確定的房屋征收部門在組織實施房屋征收與補償過程中作出行政行為，被征收人不服提起訴訟的，房屋征收部門為被告。征收實施單位受房屋征收部門委托在委托範圍內從事行為，被征收人不服提起訴訟的，房屋征收部門為被告。
第二，被告資格的轉移
具有被告資格的主體被撤銷或者其職權發生變化的，其被告資格應當轉移給其他行政機關。
(1)被告資格轉移條件。具有被告資格的行政機關或者授權組織被撤銷或者職權發生變化的，主體已經依法消滅或者作出決定的主體不再享有相關職權。
(2)行政機關被撤銷或者職權發生變化後，其職權繼續由其他主體行使。職權劃入新組建的行政機關的，由兩個機關分別行使或者收歸人民政府行使。被告是繼續行使職權的機關。
(3)行政機關被撤銷的，其行政職權隨著政府職能的轉變而不復存在，下放給企業或者社會組織的，作出撤銷決定的行政機關為被告。